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摘要:
采用HMMER与BLAST相结合的方法确定拟南芥,水稻和杨树三种模式植物全基因组JMJC蛋白基因个数分别为21,20,24,并对其染色体定位,基因结构,保守功能域进行了系统分析,在系统进化分析基础上,将JMJC家族分为11 个亚家族,内含子外显子结构分析与MPSS表达模式分析结果也进一步支持了进化关系研究.本研究有助于揭示植物JMJC基因家族的进化历史,为后续JMJ基因家族的功能提供线索,为进一步研究植物JMJC基因家族提供理论基础.
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文献信息
篇名 拟南芥、水稻和杨树JMJC家族全基因组分析
来源期刊 生物信息学 学科 生物学
关键词 拟南芥 水稻 杨树 JMJC基因家族
年,卷(期) 2010,(2) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 118-123
页数 分类号 Q811
字数 4744字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1672-5565.2010.02.006
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 尹京苑 上海大学生命科学学院 75 760 17.0 24.0
2 郭源远 上海大学生命科学学院 3 4 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
拟南芥
水稻
杨树
JMJC基因家族
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生物信息学
季刊
1672-5565
23-1513/Q
大16开
黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼
14-14
2003
chi
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