利用VBA查找核酸数据库DNA保守序列

• 作者: 尹艺林 林毅 樊洪泓 蔡永萍 詹少华
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: VBA 序列比对 保守序列 核酸数据库 大豆
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 页码范围: 299-302
• 分类号: Q518.2
• 字数: 2623字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2011.04.08

摘要

采用VBA编写了查找核酸数据库保守序列的四个相关程序,“导入DNA序列”程序可以将Fasta格式的DNA序列文本文件存放到Excel Sheetl的A列中,保留每个序列的Gi号,删除多余的注释部分；“整理DNA序列”程序可以将DNA序列Gi号存放到A列中,B列为对应Gi号的完整序列；“DNA随机序列”程序可以产生DNA随机序列；“发现DNA保守序列”程序可以将随机序列与下载的DNA序列比对,查找每一种随机序列的出现频率.以大豆基因组序列为实例,说明了这些程序的应用方法.该程序弥补了流行序列比对软件的不足,为PCR设计引物、分析基因功能以及种质资源鉴定等方面提供新的工具.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔡永萍	安徽农业大学生命科学学院	167	2775	29.0	45.0
2	林毅	安徽农业大学生命科学学院	139	2078	27.0	38.0
3	樊洪泓	安徽农业大学生命科学学院	42	540	13.0	22.0
4	詹少华	皖西学院生物与制药工程学院	27	409	12.0	20.0
5	尹艺林	皖西学院生物与制药工程学院	13	95	6.0	9.0