基于结构的单绕蛋白聚类图构建与分析

• 作者: 宋新蕊 李晓琴
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 单绕 结构比对 系统聚类 物种进化
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 研究快报
• 页码范围: 44-49
• 页数: 6页
• 分类号: Q51
• 字数: 4816字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2013.01.08

摘要

蛋白质分子进化规律研究是分子进化研究的重点,对揭示生命起源与进化机制有重要意义.本文对已知空间结构及物种信息的单绕蛋白,利用结构比对信息,构建了不同层次单绕样本系统聚类图.分析发现:功能相似蛋白存在明显聚集现象,同一超家族样本基本聚在一个大支中,同一家族样本集中在所属超家族下的小支中,功能约束下单绕样本聚类图与物种进化图有较好对应关系.结果表明:单绕蛋白的结构演化反映了蛋白质功能的约束,特定功能单绕样本的结构差异具有种属特异性,结构演化包含了物种进化信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李晓琴	北京工业大学生命科学与生物工程学院	28	71	5.0	6.0
2	宋新蕊	北京工业大学生命科学与生物工程学院	1	1	1.0	1.0