拟南芥GA2ox基因家族启动子分析

• 作者: 刘德荣 刘选明 唐冬英 段秋红 贺热情 赵小英 郭明
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: AtGA2ox基因家族 启动子 顺式元件 进化 基因表达调控
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 275-281
• 页数: 7页
• 分类号: Q344.+.13
• 字数: 5556字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2013.04.06

摘要

赤霉素是一类重要的植物激素,它参与调节植物生长发育的各个阶段.真核基因的表达受多种因素的调控,其中启动子在转录水平上的调节作用至关重要,但是目前对拟南芥GA2ox基因家族上游顺式元件的详细分析较少.本研究分析了AtGA2ox基因家族染色体定位、进化关系、蛋白模体以及顺式元件.分析结果表明:AtGA2ox基因家族分为2个亚类;具有相对集中的染色体分布;具有相似的内含子和外显子结构;AtGA2ox基因家族成员进化关系越相近,模体和顺式元件则越保守且分布位置更接近.PLACE和Plant CARE以及DMB分析显示,AtGA2ox基因家族存在许多保守元件,受多因素的调控,在此家族的上游调控区域普遍存在组织和器官特异性表达元件、光响应元件、激素响应元件以及其他环境响应元件.基因表达谱分析结果表明,在激素诱导下,AtGA2ox基因家族均有响应.这些元件不仅作为正调控元件,诱导部分AtGA2ox基因的表达,而且还能作为负调控元件,抑制其他AtGA2ox基因的表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵小英	湖南大学生物学院	33	159	8.0	11.0
2	唐冬英	湖南大学生物学院	40	328	12.0	17.0
3	刘选明	湖南大学生物学院	88	747	16.0	23.0
4	郭明	湖南大学生物学院	5	27	3.0	5.0
5	段秋红	湖南大学生物学院	2	17	2.0	2.0
6	贺热情	湖南大学生物学院	5	21	3.0	4.0
7	刘德荣	湖南大学生物学院	2	16	2.0	2.0