细胞信号网络功能鲁棒的简并性拓扑特征

• 作者: 原亮 张娅 满梦华 蔡娜 褚杰 马贵蕾
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 物理学
• 关键词: 细胞信号网络 布尔网络模型 简并性 冗余性 鲁棒性
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 研究快报
• 页码范围: 40-46
• 页数: 7页
• 分类号: O441.1
• 字数: 7434字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2015.01.08

摘要

细胞信号网络对于外界环境的干扰表现出优良的鲁棒性，但是其维持功能鲁棒的内在机制尚未明确，本文研究了细胞信号网络功能鲁棒性的拓扑特征。选择布尔网络模型模拟细胞网络的动态行为，利用网络节点状态的扰动模拟外界环境干扰。基于演化策略探寻不同网络拓扑的功能并分析其在干扰环境下的鲁棒性，采用埃德尔曼提出的基于信息论的计算方法评估网络拓扑的简并度、冗余度和复杂度等拓扑属性，对比分析它们与功能鲁棒度的相关性及作用机理。结果显示，在网络模型的演化过程中，其拓扑简并度与功能鲁棒度显著正相关，相关性水平高于拓扑冗余度与鲁棒度的相关性。并且，随着鲁棒度的提升，网络的节点数和复杂度也随之升高，同样简并度与网络的节点数和复杂度的相关性高于拓扑冗余度与网络的节点数和复杂度的相关性。这说明增加的网络节点以简并的方式同时提高了网络拓扑的鲁棒度和复杂度。因此，细胞网络功能鲁棒性的拓扑特征是简并而不是冗余，简并为解决生物系统的复杂问题提供了有效手段，为人工系统的可靠性设计提供有益的借鉴。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	原亮	军械工程学院电磁环境效应国家级重点实验室	68	623	12.0	21.0
2	褚杰	军械工程学院电磁环境效应国家级重点实验室	26	229	7.0	14.0
3	满梦华	军械工程学院电磁环境效应国家级重点实验室	28	152	7.0	9.0
4	蔡娜	军械技术研究所信息化与标准室	2	2	1.0	1.0
5	马贵蕾	军械工程学院电磁环境效应国家级重点实验室	2	2	1.0	1.0
6	张娅	军械工程学院电磁环境效应国家级重点实验室	1	2	1.0	1.0