伴 HBV 感染性肝癌调控枢纽基因筛选与初步鉴定

• 作者: 孙维华 孙鸽 寇铮 尧晨光 朱祥 胡康洪
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 乙型肝炎病毒(HBV) HBV相关性肝癌 GO分析 WGCNA 共表达模块 枢纽基因 SHARPIN
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 203-212
• 页数: 10页
• 分类号: Q343.1
• 字数: 5500字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2016.04.02

摘要

慢性乙型肝炎病毒（Hepatitis B virus，HBV）感染引起的原发性肝癌涉及多种基因、转录本和蛋白质的相互作用及调控。从单个基因的角度来看，某个基因的表达量的改变只能对肝癌发生发展的局部作出解释而无法从整体行为进行深入和全面的探索，无法满足高度复杂性的调控研究需要。筛选乙肝相关性肝癌的基因芯片数据获取差异表达基因后，应用加权基因共表达网络分析算法构建基因共表达网络，识别与肝癌发生相关的模块，利用可视化筛选枢纽基因，并针对枢纽基因进行基因本体富集分析和初步验证。富集分析和文献挖掘一致发现，某些枢纽基因确实与多种癌症的发生与发展存在显著的关联。权重基因共表达网络分析方法被证明是一个高效的系统生物学方法，应用该方法发现了新的HBV相关性肝癌枢纽基因。经实验验证，发现枢纽基因SHARPIN促进细胞迁移。该研究对肝癌发生的调控机制以及发现HBV慢性感染导致肝癌的新型诊断标志物和（或）药物作用靶点提供了新的视野。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙维华	湖北工业大学中德生物医学中心	2	3	1.0	1.0
2	朱祥	湖北工业大学中德生物医学中心	2	3	1.0	1.0
3	尧晨光	湖北工业大学中德生物医学中心	5	10	2.0	3.0
4	孙鸽	湖北工业大学中德生物医学中心	3	7	2.0	2.0
5	寇铮	湖北工业大学中德生物医学中心	4	3	1.0	1.0
6	胡康洪	湖北工业大学中德生物医学中心	7	5	2.0	2.0