基于转录组测序数据分析及高通量GO注释理论的研究

• 作者: 刘粉香 孙勤红 杨文国
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 二代测序 转录组 从头拼接 GO注释
• 年，卷（期）: 2018,（31）
• 所属期刊栏目: 动物科学·生物技术
• 页码范围: 88-91,100
• 页数: 5页
• 分类号: Q-3
• 字数: 6674字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2018.31.027

摘要

随着二代测序技术的快速发展,转录组测序在越来越多的动植物中完成,人们获得了大批量的转录组数据序列.如何从这些海量的序列数据中挖掘具有生物意义的信息已成为很多研究的关键所在,对未知基因的功能进行预测和注释就是其中一个重要的问题.转录组序列的功能注释是功能基因组学研究的一项重要内容,基因本体论(gene ontology,GO)注释目前是一种最重要的功能注释方式.介绍了利用生物信息学软件进行转录组测序数据分析过程,包括数据质量控制和过滤、从头拼接(De novo assembly)、同源比对以及大规模GO注释,为从事转录组测序特别是非模式植物转录组测序研究者在数据分析方面提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨文国		25	27	4.0	4.0
2	孙勤红		16	33	3.0	5.0
3	刘粉香		9	15	2.0	3.0