甜瓜热激转录因子(Hsf)基因家族鉴定及生物信息学分析

• 作者: 刘大伟 司修洋 梁文杰 汪宇欣 罗澜
• 来源期刊: 中国蔬菜
• 关键词: 甜瓜 Hsf基因家族 系统发育 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（11）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 23-32
• 页数: 10页
• 语种: 中文

摘要

热激转录因子(heat shock transcription factor,Hsf)是植物胁迫抗性调控中的一类重要因子,在植物胁迫应答和生长发育调控中起着关键作用.本试验基于甜瓜(Cucumis melo L.)基因组数据,利用生物信息学手段对CmHsf家族进行鉴定,并对其基因结构、位置信息、系统发育、共线性关系及启动子等进行了分析.结果 表明:在甜瓜基因组数据中共鉴定到22个CmHsf基因家族成员,这些基因不均匀地分布在11条染色体上,所有基因均含有内含子,且内含子数量大多为1～2个;根据蛋白结构和系统发育分析,CmHsf可被分为3个类群,各类群数量不等,与其他植物Hsf基因在类群划分上具有一定的相似性;在与模式植物拟南芥进行同源进化分析中,系统进化树将所有的CmHsf基因家族聚为3类;在共线性分析中,甜瓜共有19个基因与黄瓜、西瓜存在共线性关系;在启动子分析中,鉴定到脱落酸、茉莉酸、生长素、赤霉素以及干旱、低温、机械损伤等信号响应顺式作用元件.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘大伟		27	56	4.0	5.0
2	司修洋		3	3	1.0	1.0
3	罗澜		2	0	0.0	0.0
4	梁文杰		1	0	0.0	0.0
5	汪宇欣		1	0	0.0	0.0