大肠杆菌sigma70启动子预测

• 作者: 李前忠 林昊
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 医学
• 关键词: 大肠杆菌 sigma70启动子 离散增量
• 年，卷（期）: 2007,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 12-14
• 页数: 3页
• 分类号: R3
• 字数: 1934字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2007.01.004

摘要

统计了大肠杆菌sigma70启动子在不同基因间的分布.计算了683条大肠杆菌sigma70启动子的每个位点六联体的保守性M6(l)值及涨落限,以大于涨落限7.2的21个保守位点的六联体频数作为参数,利用离散增量理论对大肠杆菌全序列进行启动子搜索.结果显示683条启动子序列被全部正确预测且得到126条预测序列,利用启动子在不同基因间的分布和TSS到TIS的距离分布进行二次筛选,推测其中的84条序列是实验未测定的启动子序列.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李前忠	内蒙古大学理工学院物理系	87	366	11.0	15.0
2	林昊	内蒙古大学理工学院物理系	14	79	4.0	8.0