采用基于Gene Ontology的聚类方法研究白血病的遗传异质性

• 作者: 姚晨 彭春方 朱晶 李永进 杨达 王栋 王靖 肖国华 郭政
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 基因表达谱 Gene Ontology 聚类分析 遗传异质性
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 9-11
• 页数: 3页
• 分类号: Q61
• 字数: 2673字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2008.01.004

摘要

采用基因表达谱可以研究基因功能模块与疾病异质性之间的关系.根据两套白血病基因表达谱数据,将富集高变异基因的Gene Ontology基因功能模块作为特征功能模块,将疾病样本聚为两类.通过对比原始多类标签,采用聚类评估指标来分析两类化聚类结果的效果,并探讨特征功能模块与疾病异质性之间的关系.实验结果显示:在两套不同的白血病基因表达谱数据中得到的特征功能模块类似,它们对白血病亚型有较强的分型能力.