不同转录频率的酵母基因启动子序列结构差异性分析

• 作者: 张静 潘志锋
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 酵母基因 转录频率 启动子 Markov模型
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 页码范围: 325-329
• 分类号: Q811.4
• 字数: 4495字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2010.04.010

摘要

不同基因的转录效率一般会有差异,启动子序列的组织结构可能是造成差异的原因之一.本文分别基于出现频率、Markov模型以及加权Markov模型计算出所有6碱基片段(6-mer)在不同转录频率的酵母基因启动子序列中的分布,然后利用最大最小贴近度方法分析这些基因启动子序列结构的差异情况.结果表明,酵母基因的转录频率与启动子序列结构的确有关联,转录频率相差较大的基因,它们的启动子序列结构差异一般也较大.统计分析还表明,高阶(3阶和4阶)加权Markov模型可以更有效地反映基因启动子序列的结构特征.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张静	云南大学数学与统计学院	50	141	7.0	10.0
2	潘志锋	云南大学数学与统计学院	2	5	2.0	2.0