一种新的蛋白质结构字母序列优化算法

• 作者: 孙汉顺 孙立哲 郑文岭 马文丽 高静宇
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 工学
• 关键词: 结构字母 基本贪婪算法 全局贪婪算法
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 页码范围: 202-205
• 分类号: TP391
• 字数: 2516字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2010.03.005

摘要

基于蛋白质结构字母的预测和分析方法,一个必然的步聚,是将目标蛋白质离散成结构字母序列.本文在对蛋白质结构字母序列空间,及其最小根均方偏差变化,穷举分析的基础上,提出了一种新的蛋白质结构字母序列优化算法,全局贪婪算法.全局贪婪算法避免了基本贪婪算法过度依赖候选集大小,计算量过大、以及过早收缩于局部最小等缺点.经实验分析,全局贪婪算法在性能上优于基本贪婪算法和局部最优方法..

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马文丽	上海大学电子生物中心	275	1255	15.0	23.0
3	郑文岭	上海大学电子生物中心	94	308	8.0	12.0
9	高静宇	上海大学电子生物中心	3	3	1.0	1.0
13	孙汉顺	上海大学电子生物中心	3	3	1.0	1.0
14	孙立哲	上海大学电子生物中心	3	3	1.0	1.0