面向新一代基因组测序技术的序列拼接算法

• 作者: 卢志远 孙啸 王亚旭 逯雯雯
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 基因组测序 序列拼接 短片段
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 页码范围: 248-253
• 分类号: Q78
• 字数: 7391字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2010.03.016

摘要

随着新一代测序技术的发展,新的拼接算法应运而生.介绍了目前国际上广泛认可的几种新的拼接算法的基本原理与具体步骤,分析每种算法的优缺点以及适用范围.用Helicobacter acinonychis的Illumina 1G测序数据检测SSAKE,VCAKE,SHARCGS以及velvet的性能,并对未来拼接算法的研究提出展望.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙啸	生物电子学国家重点实验室东南大学生物科学与医学工程学院	3	13	3.0	3.0
2	逯雯雯	生物电子学国家重点实验室东南大学生物科学与医学工程学院	1	4	1.0	1.0
3	卢志远	生物电子学国家重点实验室东南大学生物科学与医学工程学院	1	4	1.0	1.0
4	王亚旭	生物电子学国家重点实验室东南大学生物科学与医学工程学院	1	4	1.0	1.0