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摘要:
癌是一种涉及多基因变异的遗传异质性疾病,涉及多种生物学功能通路中不同基因的遗传变异.因此,识别癌基因是一项富有挑战性的工作.提出通过寻找在癌样本中突变显著共发生的基因筛选候选癌基因的方法.应用该方法,通过分析蛋白激酶基因在癌组织中的突变谱数据,发现了167个显著共发生突变的基因对,包含85个基因.分析这167个基因对发现:(1)发生共突变的基因富集已知的癌基因;(2)共突变基因对倾向于共扰动与癌症相关的通路对.以上结果提示,在癌样本中显著共发生突变的基因倾向于候选癌基因;在癌发生过程中起重要作用的基因倾向于协同扰动不同的癌相关细胞生物学过程.
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文献信息
篇名 根据在癌突变谱中的共突变基因对识别癌基因
来源期刊 生物信息学 学科 生物学
关键词 癌基因 突变谱 基因功能 功能通路
年,卷(期) 2011,(3) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 217-219,223
页数 分类号 Q518.2
字数 2294字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1672-5565.2011.03.010
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 张杨 电子科技大学生命科学与技术学院生物信息学中心 15 25 3.0 3.0
2 沈晓沛 电子科技大学生命科学与技术学院生物信息学中心 3 4 1.0 1.0
3 王靖 电子科技大学生命科学与技术学院生物信息学中心 7 10 2.0 3.0
4 朱晶 电子科技大学生命科学与技术学院生物信息学中心 11 13 2.0 2.0
5 郭政 电子科技大学生命科学与技术学院生物信息学中心 9 10 2.0 2.0
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研究主题发展历程
节点文献
癌基因
突变谱
基因功能
功能通路
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生物信息学
季刊
1672-5565
23-1513/Q
大16开
黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼
14-14
2003
chi
出版文献量(篇)
937
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6
总被引数(次)
4610
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导