鸡MyD88-TIR的同源模建

• 作者: 刘冉冉 文杰 赵兴旺 赵桂苹 郑麦青 陈继兰
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 农学
• 关键词: 鸡 MyD88 - TIR 同源建模 合理性评估
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 页码范围: 331-334,338
• 分类号: S831.2
• 字数: 3721字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2011.04.15

摘要

髓样分化因子( MyD88)是Toll受体(TLR)信号通路中的一个关键接头分子,在传递信息和介导炎症反应中具有重要的作用.对鸡MyD88(Myeloid differentiation primary response protein MyD88)的TIR(Toll - interleukin 1- resistance)区域进行同源建模,并评估其可用性,为进一步研究MyD88与TLR( Toll receptor)相互作用的原理奠定基础.通过结构域分析、模板相似性搜索和序列比对、初始建模、精修和动力学优化,立体化学结构和能量合理性评估,获得未知三维结构的鸡MyD88 - TIR三维模型.结果表明,鸡MyD88包含DEATH和TIR两个结构域,所模拟的MyD88 - TIR三维模型二面角构象和氨基酸能量分布以及主侧链立体化学特性合理.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	文杰	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	90	1414	20.0	35.0
2	赵桂苹	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	51	674	14.0	25.0
3	郑麦青	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	52	860	16.0	28.0
4	陈继兰	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	64	1291	19.0	34.0
5	刘冉冉	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	21	59	5.0	6.0
6	赵兴旺	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	3	15	2.0	3.0