野葛葡糖基转移酶PlUGTs的同源建模及其活性位点分析

• 作者: 李晓云 李玲 郑敏婧
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 医学
• 关键词: PlUGT 同源建模 分子对接
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 研究快报
• 页码范围: 287-292
• 页数: 6页
• 分类号: R978.1+6
• 字数: 3457字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2013.04.08

摘要

本文对PIUGTs进行同源建模,并分析其与底物结合的构象及活性位点.通过SWISS-MODEL在线对PlUGTs进行模板预测和选择,运用Swiss-PdbViewer软件显示和优化,利用ACDLABS绘制糖基供体小分子(酶结合底物),最后通过AutoDock_ADT进行分子对接,并分析PlUGTs酶与不同底物结合的整体构象及分析活性位点.研究结果表明PlUGT1、PlUGT2及PlUGT3均能得到较好的三级构象,并且PlUGT1、PlUGT2与三种底物均可进行较好对接,H18,R278,N359为PlUGT1与三种对接构象活性中心所共有的氨基残基;而G16,H17,V19,T148,N370,E374,E390为PlUGT2与三种对接构象活性中心所共有的氨基残基,但PlUGT3未能得到较好的对接构象.由此推测PlUGT1和PlUGT2均能合成葛根素,而PlUGT3不能催化葛根素的合成.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李玲	华南师范大学生命科学学院	173	2204	27.0	39.0
2	李晓云	华南师范大学生命科学学院	6	11	2.0	3.0
3	郑敏婧	华南师范大学生命科学学院	1	2	1.0	1.0