纤维二糖水解酶Ⅰ基因的系统进化分析

• 作者: 田兴军 陈笑笑
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 纤维二糖水解酶Ⅰ(CBHI) 系统进化 序列比对
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 研究快报
• 页码范围: 300-308
• 页数: 9页
• 分类号: Q343.1+5
• 字数: 4496字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2013.11.

摘要

纤维二糖水解酶Ⅰ(CBH Ⅰ)是生物降解纤维素的一种重要的外切酶,它作用于纤维素分子末端,水解β-1,4-糖苷键.纤维二糖水解酶由3个部分组成:具有催化活性的催化结构域,作用为锚定纤维素的纤维素结合域以及连接这两个结构域的一段短肽.已知催化结构域属于糖基水解酶家族7(GH7),纤维素结合域属于糖类结合模块家族Ⅰ(CBM1).为进一步探索CBHI编码基因之间的进化关系,本研究依据CBHI的结构域在GenBank数据库中搜索并鉴定CBHI编码基因并据此构建系统发育树.序列的平均长度为1 776 bp,平均GC含量为57.64％,平均转换颠换比为0.71,平均遗传距离为0.424.得出结论CBHI编码基因只存在于真菌中,是一个相对活跃的基因,它的进化与物种的进化有着密切的关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	田兴军	南京大学生命科学学院	61	816	16.0	27.0
2	陈笑笑	南京大学生命科学学院	1	4	1.0	1.0