GPGPU加速生物序列比对研究进展

• 作者: 孙一桐 沈玉琳 者建武 金能智 马尧
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 化学
• 关键词: GPGPU 序列比对 数学库函数
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 115-119
• 页数: 5页
• 分类号: Q526|O641
• 字数: 4190字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2013.02.07

摘要

序列比对是生物信息学中最常用和最经典的研究手段.生物序列比对需要有强大计算能力的硬件支撑,而近年快速发展起来的GPGPU正好可堪此任.本文首先介绍GPGPU的发展过程,进而讲述GPGPU硬件设备与其编程环境,然后对GPGPU做科学计算时需要的数学库函数做一介绍,最后综述近年来国内外基于GPGPU的生物序列比对软件和相关研究工作,并总结和展望其辉煌前景.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	者建武	甘肃省云计算重点实验室甘肃省计算中心	2	1	1.0	1.0
2	金能智	甘肃省云计算重点实验室甘肃省计算中心	2	1	1.0	1.0
3	马尧	甘肃省云计算重点实验室甘肃省计算中心	2	1	1.0	1.0
4	沈玉琳	甘肃省云计算重点实验室甘肃省计算中心	2	1	1.0	1.0
5	孙一桐	甘肃省云计算重点实验室甘肃省计算中心	1	1	1.0	1.0