α-葡萄糖苷酶与米格列醇相互作用及其进化关系

• 作者: 赵娅敏 金能智 陆会宁 齐燕姣
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 工学
• 关键词: α-葡萄糖苷酶 相互作用 序列比对 系统发育关系
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 141-149
• 页数: 9页
• 分类号: TP925+.4
• 字数: 4393字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2015.03.01

摘要

用生物信息学的方法分析不同物种的α-葡糖糖苷酶的亲缘关系,分析降血糖药物米格列醇与甜菜( Beta vulgaris)的α-葡糖糖苷酶相互作用位点在其他亲缘关系较近的物种中相应的氨基酸变化特点,结果表明米格列醇位于一个凹向酶分子内部的狭窄的结合口袋中,其间的相互作用主要以静电相互作用、氢键和范德华力为主. 由于米格列醇的强水溶性和多羟基的特点,与酸性的天冬氨酸之间形成多个O-H氢键,对甜菜( Beta vulgaris)的α-葡萄糖苷酶具有较好的抑制作用. 通过TM-HMM预测甜菜( Beta vulgaris)的α-葡萄糖苷酶的序列,结果未发现跨膜区. 通过多序列比对发现,在米格列醇与甜菜( Beta vulgaris)的α-葡萄糖苷酶相互作用位点处的氨基酸中,在与其亲缘关系较近的5个物种茶( Camellia sinensis) ,黄瓜( Cucumis sativus),木本棉(Gossypium arboretum),甘庶属割手密(Spontaneum)和蒺藜状苜蓿(Medicago truncatula)中有81.82%的氨基酸都是保守的,且主要是极性的氨基酸,如色氨酸和天冬氨酸. 这为进一步研究降血糖药物在其他物种中的表现及相互作用提供了重要的科学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	金能智		18	20	2.0	3.0
2	陆会宁	西北民族大学榆中校区生命科学与工程学院	17	56	4.0	6.0
3	齐燕姣	西北民族大学榆中校区化工学院	13	26	3.0	4.0
4	赵娅敏	西北民族大学榆中校区化工学院	7	29	3.0	5.0