几种植物淀粉合成酶的生物信息学分析

• 作者: 孔维宝 武国凡 牛世全 田亚珍 秦绪军
• 来源期刊: 食品与生物技术学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 植物 淀粉合成酶 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2018,（9）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 948-954
• 页数: 7页
• 分类号: Q559
• 字数: 4354字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-1689.2018.09.008

摘要

采用生物信息学方法比对分析了马铃薯、红薯、小麦、高粱、南瓜、水稻等6种植物的淀粉合成酶(SS)的核苷酸和氨基酸序列,对其甲基化位点、组成成分、理化性质、疏水性/亲水性、跨膜结构域、蛋白质二级结构、功能结构域进行预测和分析.结果表明:红薯、小麦、高粱和水稻都含有甲基化位点,马铃薯和南瓜不合甲基化位点.SS的平均全长为1 847 bp,开放阅读框的长度约为877 bp,起始密码子为ATG,终止密码子有3种;开放阅读框所编码的氨基酸残基平均数286,平均相对分子质量为31 915.88;平均等电点为8.264 5,中性溶液中平均带电荷为-0.598 1;平均亲水氨基酸63个、疏水氨基酸102个,SS为疏水性蛋白.6种植物的SS含有2个跨膜结构,其二级结构以无规则卷曲和延伸链为主要构件.通过进化树分析淀粉合成酶,小麦和高梁进化程度相似,和南瓜的进化相距较远.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	秦绪军	第四军医大学预防医学院	36	201	9.0	12.0
2	武国凡	西北师范大学生命科学学院	18	48	5.0	6.0
3	孔维宝	西北师范大学生命科学学院	107	608	11.0	20.0
4	牛世全	西北师范大学生命科学学院	62	725	13.0	25.0
5	田亚珍	西北师范大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0