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张家界市酸鱼细菌类群解析及其功能预测
张家界市酸鱼细菌类群解析及其功能预测
作者:
席啦
凌霞
刘长玲
杨江
张振东
郭壮
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
酸鱼
高通量测序
细菌类群分析
功能预测
摘要:
该研究采用Illumina MiSeq高通量测序技术对采集自张家界市的7个酸鱼样品进行了细菌类群分析,结果发现厚壁菌门(Fir-micutes)为优势菌门,其平均相对含量为95.49%.优势细菌属为乳酸杆菌属(Lactobacillus)、四联球菌属(Tetragenococcus)和葡萄球菌属(Staphylococcus),其平均相对含量分别为66.53%、11.77%和8.10%.发现8个核心分类操作单元中有6个注释为Lactobacillus,各有1个注释为Tetragenococcus和Staphylococcus,其中乳酸菌的累计平均相对含量达60.27%.PICRUSt技术预测酸鱼菌群功能结果表明,酸鱼中的细菌菌群在"氨基酸转运与代谢"和"碳水化合物运输和代谢"功能上表达较高,说明菌群在代谢方面的功能比较突出.由此可见,张家界地区酸鱼中蕴含了丰富的乳酸菌资源,且以Lactobacillus、Tetragenococcus和Lactococcus为主.
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文献信息
篇名
张家界市酸鱼细菌类群解析及其功能预测
来源期刊
中国酿造
学科
工学
关键词
酸鱼
高通量测序
细菌类群分析
功能预测
年,卷(期)
2021,(2)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
92-96
页数
5页
分类号
TS254.4
字数
语种
中文
DOI
10.11882/j.issn.0254-5071.2021.02.018
五维指标
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酸鱼
高通量测序
细菌类群分析
功能预测
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
中国酿造
主办单位:
中国调味品协会
北京食品科学研究院
出版周期:
月刊
ISSN:
0254-5071
CN:
11-1818/TS
开本:
大16开
出版地:
北京市西城区禄长街头条4号
邮发代号:
2-124
创刊时间:
1982
语种:
chi
出版文献量(篇)
9236
总下载数(次)
44
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