生物信息学期刊
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生物信息学

China Journal of Bioinformatics

CSTPCD

影响因子 0.3945
本刊是由哈尔滨工业大学主办的生物信息及相关领域的国内外公开发行的学术刊物,报道我国生物信息技术研究开发的重要成果和国内外生物信息技术及其产业化最新进展。
主办单位:
哈尔滨工业大学
ISSN:
1672-5565
CN:
23-1513/Q
出版周期:
季刊
邮编:
150001
地址:
黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼
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  • 作者: 俞志明 宋秀贤 曹西华 董声 韩笑天
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2013年2期
    页码:  79-85
    摘要: 本文以真核藻类18S rDNA类群特异性PCR引物的设计与评估为例,详细介绍了如何利用Primrose等一系列程序设计类群特异性PCR引物并评估其敏感性与特异性,并对这一方法的优势与应用类群...
  • 作者: 史小红 李晋惠 胡睿
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2013年2期
    页码:  86-90
    摘要: 蛋白质折叠速率的正确预测对理解蛋白质的折叠机理非常重要.本文从伪氨基酸组成的方法出发,提出利用序列疏水值震荡的方法来提取蛋白质氨基酸的序列顺序信息,建立线性回归模进行折叠速率预测.该方法不需...
  • 作者: 张玉叶 王建华 罗俊 苏亚春 苏炜华 许莉萍 阙友雄 黄宁
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2013年2期
    页码:  91-99
    摘要: 应用电子克隆技术,以水稻EF576477序列为探针,获得了甘蔗天冬氨酰半醛脱氢酶基因(aspartate-semialdehyde dehy-drogenase,ASADH)的一条cDNA全...
  • 作者: 刘国庆 刘红梅
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2013年2期
    页码:  100-104
    摘要: 随着越来越多基因组的测序完成,基于全基因组的非比对的系统发生分析已成为研究热点.不同的生物物种或个体基因组之间的核酸组分不完全相同.遗传语言-DNA序列的信息很大程度上反映在其k-mer频数...
  • 作者: 刘海军 朱克明 杨艳华 邱旭华 陈克平
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2013年2期
    页码:  105-108
    摘要: 基于Make2D-DB Ⅱ软件包构建了一个水稻二维电泳-质谱联动数据库Rice2DDB,介绍了该数据库的构建方法和步骤,为快速发展的水稻蛋白质组学研究提供了数据管理和交流的平台,对其他物种的...
  • 作者: 于平 杨卫芳 章慧慧
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2013年2期
    页码:  109-114
    摘要: 根据已克隆的内切几丁质酶基因序列的同源性比较,设计引物,采用PCR技术从绿色木霉基因组中分离出一个大小为1467bp的特异DNA片段,采用RT-PCR技术从绿色木霉总RNA中分离出大小约1 ...
  • 作者: 孙一桐 沈玉琳 者建武 金能智 马尧
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2013年2期
    页码:  115-119
    摘要: 序列比对是生物信息学中最常用和最经典的研究手段.生物序列比对需要有强大计算能力的硬件支撑,而近年快速发展起来的GPGPU正好可堪此任.本文首先介绍GPGPU的发展过程,进而讲述GPGPU硬件...
  • 作者: 刘巧红 彭雪 李凯 李娅楠 杨林
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2013年2期
    页码:  120-123
    摘要: 为了探讨大米蛋白对成熟期大鼠胆固醇代谢调控因子-低密度脂蛋白受体(low-density lipoprorein receptor,LDLR)的调控作用,以18周龄雄性Wistar成熟期大鼠...
  • 作者: 丁程 李晓琴
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2013年2期
    页码:  124-129
    摘要: 热稳定性相关区域的识别是蛋白耐热性改造的关键问题之一.本文以枯草杆菌蛋白(SUBTILISIN BPN('))为研究对象,通过枯草杆菌蛋白同源家族序列的统计耦联分析,提取枯草杆菌蛋白中的保守...
  • 作者: 刘志刚 杨波 胡征 邓贝
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2013年2期
    页码:  130-135
    摘要: 运用同源模建的方法构建了pACY1三维结构模型,并在能量最小化后对模型进行分子动力学模拟和结构合理性评估.同源模建生成了50个原始模型,经过PROCHECK评测后,筛选出模型A、B进行能量最...
  • 作者: 周鸿敏 徐洪来 杨超 肖敏 陈忠华 雒真龙 高义
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2013年2期
    页码:  136-141
    摘要: 应用生物信息学方法分析肝移植临床耐受患者PBMC基因表达特征,筛选临床耐受关键基因.从GEO数据库获取19个肝移植临床耐受病例及22个非临床耐受病例基因表达谱数据.应用DAVID网络软件进行...
  • 作者: 刘俊宏 李春
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2013年2期
    页码:  142-145
    摘要: 借助DNA序列中k-字的频数,将序列转化成一个340维向量,进而计算物种间的进化距离.作为应用:分别以15个物种的β球蛋白基因、13种汉坦病毒的S片段以及26个闭壳龟线粒体基因为例,构建系统...
  • 作者: 张岩波 李治 杨圆圆 罗艳虹 贾志杰
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2013年2期
    页码:  146-149
    摘要: 采用结构方程混合模型(SEMM)对实际SNP数据进行分析,为遗传统计学提供一种新的有效的分析方法.本研究的数据是由GAW17提供的,包含697个个体的22条常染色体的上万个SNP和根据这些S...
  • 作者: 丰继华 单秋甫 卢英 肖建平
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2013年2期
    页码:  150-152,160
    摘要: 在利用核小体定位实验数据训练支持向量机(SVM)对任意酵母DNA序列的核小体形成能力进行预测的过程中,发现染色质结构对基因组DNA分子进化过程有着显著影响.我们观察到核小体DNA比连接DNA...
  • 作者: 张晶红 束永俊 王明波 王晓萍 郭东林 郭长虹
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2013年2期
    页码:  153-157
    摘要: 生物体有部分基因被转录成RNA,但是不编码相应蛋白质,称为长链非编码RNA(IncRNA).它们参与基因的表观调控,这一过程对动物、植物的生长发育都有重要作用,但是,目前植物中发现和研究的I...
  • 作者: 何东力 彭艳辉
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2013年2期
    页码:  158-160
    摘要: 目前在众多的分子马达中对骨骼肌肌球蛋白的研究较多,本文对肌球蛋白的结构、工作循环机制以及单分子动力学性质进行了探索.同时,对各种生化条件下肌纤维的收缩性质进行了测试.将Houdusse和Sw...

生物信息学基本信息

刊名 生物信息学 主编 任南琪
曾用名
主办单位 哈尔滨工业大学  主管单位 中华人民共和国工业和信息化部
出版周期 季刊 语种
chi
ISSN 1672-5565 CN 23-1513/Q
邮编 150001 电子邮箱 itgene@sohu.com
电话 0451-86414135;0451-86417711(吴永英) 网址 http://swxxx.alljournals.cn/ch/index.aspx
地址 黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼

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