几种模式生物基因组中最适密码对和稀有密码对使用的规律性

• 作者: 王志坚 王芳平
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 密码对 双碱基:密码子的相对频率 基因组
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 页码范围: 327-330
• 分类号: Q61
• 字数: 3982字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2011.04.14

摘要

以6种模式生物基因组为样本,从密码对的碱基组成及密码子的使用两方面,分析了最适密码对与稀有密码对的使用.结果显示:6种生物的最适密码对rP双碱基TA出现的频数都是最低的,而出现频率最大的双碱墓对于古菌、细菌、真核是不同的；稀有密码对中双碱基TA出现的频数却是最高的,而出现频率最低的双碱基刘·于古菌、细菌、真核是不同的.这说明双碱基的分布与密码对的偏好性有很强的相关性,同时也与基因组进化存在关联.另外,我们也分析了本文的6种生物编码序列叶,最适密码对与稀有密码对的出现频数与密码了的相对使用频率的关系,发现密码对的出现频数与其密码子的使用存在相关性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王志坚	天水师范学院物理与信息科学学院物理系	23	36	4.0	4.0
2	王芳平	天水师范学院物理与信息科学学院物理系	8	5	1.0	1.0