基于一致序列多样性分析的启动子预测方法

• 作者: 张文燕 武栓虎 王敏强
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 工学
• 关键词: 启动子预测 真核生物 CpG岛 区间位置权重矩阵
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 页码范围: 211-216
• 分类号: TP391
• 字数: 4670字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2012.03.14

摘要

基于启动子的以下特点:(1)启动子区域有一些一致序列,但对于不同的启动子,一致序列在个别碱基上会有所改变,具有多样性;(2)一致序列的位置并不固定,总是在某个范围内波动;(3)大部分的真核生物启动子都和CpG岛有关.提出了一个新的启动子预测方法,即采用了一种新的统计建模策略,并首次提出了区间位置权重矩阵(IPWM)概率模型.大规模序列测试结果表明,新的启动子预测系统具有较好的敏感性和特异性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王敏强	烟台大学生命科学学院	32	215	8.0	14.0
2	武栓虎	烟台大学计算机学院	19	46	3.0	5.0
3	张文燕	烟台大学计算机学院	1	1	1.0	1.0