齿肋赤藓热激蛋白60基因的电子克隆和生物信息学分析

• 作者: 张道远 蔡明 高贝
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 齿肋赤藓 热激蛋白60 电子克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 研究快报
• 页码范围: 216-223
• 页数: 8页
• 分类号: Q785
• 字数: 4260字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2013.03.10

摘要

用电子克隆方法获得耐旱苔藓齿肋赤藓的热激蛋白60基因,采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白从氨基酸组成、结构保守域、理化性质、信号肽、疏水性/亲水性、亚细胞定位、跨膜结构域、二级结构、功能域、活性位点、及同源性等方面进行了预测和分析.结果表明:齿肋赤藓热激蛋白60基因全长1841bp,开放阅读框1581bp,编码526个氨基酸残基；编码蛋白含有GroEL保守域,是chaperon-like superfamily家族；亚细胞定位分析显示,编码蛋白位于内质网中；活性化位点分析表明,编码蛋白存在6类活性位点；同源性分析表明,齿肋赤藓热激蛋白60与小立碗藓预测的HSP60同源性最高,达到92％,与卷柏的HSP60次之,同源性达88.83％.研究结果为该基因的实验克隆奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张道远	中国科学院干旱区生物地理与生物资源重点实验室中国科学院新疆生态与地理研究所	44	1021	16.0	31.0
2	高贝	中国科学院干旱区生物地理与生物资源重点实验室中国科学院新疆生态与地理研究所	6	13	2.0	3.0
6	蔡明	中国科学院干旱区生物地理与生物资源重点实验室中国科学院新疆生态与地理研究所	2	36	2.0	2.0