REP-PCR及ERIC-PCR法对分离自海产品副溶血性弧菌分型分析

• 作者: 卢瑛 吴启华 孙晓红 潘迎捷 赵勇 马月姣
• 来源期刊: 食品科学
• 学科: 工学
• 关键词: 副溶血性弧菌 tdh 肠内细菌基因组间重复序列分析 细菌基因外重复回文序列扩增 分型
• 年，卷（期）: 2013,（10）
• 所属期刊栏目: 分析检测
• 页码范围: 263-267
• 页数: 5页
• 分类号: TS201.3
• 字数: 3769字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7506/spkx1002-6630-201310058

摘要

目的:采用细菌基因外重复回文序列扩增(REP-PCR)和肠道细菌基因间重复序列扩增(ERIC-PCR)两种方法对副溶血性弧菌2株标准株,13株实验室保存菌株和73株分离菌株共88株进行分子分型.方法:通过REP和ERIC-PCR指纹图谱扩增,利用NTsys-pc软件采用Dice系数对指纹图谱进行聚类结果分析.结果:所有供试菌株可通过此两种方法进行分型得到清晰的指纹图谱,并反映出副溶血性弧菌具有丰富的遗传多样性,REP-PCR扩增出5～9条分布在609～4200bp之间的条带,可将副溶血性弧菌分为5个群12类型,分辨指数达0.93,其中tdh+株在相似系数0.86时可聚类在第Ⅰ群；ERIC-PCR扩增出5～11条分布在400～7593bp之间的条带,将副溶血性弧菌分为7个群11个类型,分辨指数为0.94,其中tdh+株在相似系数0.76时可聚类在第Ⅰ群.结论:两种方法均显现出很好的分型能力,能够很好地将环境分离tdh+菌株和标准菌株聚类在一起,其中REP-PCR较ERIC-PCR重复性更好.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵勇	上海海洋大学食品学院上海水产品加工及贮藏工程技术研究中心	111	1316	20.0	30.0
2	孙晓红	上海海洋大学食品学院上海水产品加工及贮藏工程技术研究中心	75	591	13.0	18.0
3	马月姣	上海海洋大学食品学院上海水产品加工及贮藏工程技术研究中心	4	14	1.0	3.0
4	吴启华	上海海洋大学食品学院上海水产品加工及贮藏工程技术研究中心	1	13	1.0	1.0