基于PDB数据库的三个RNA二级结构预测软件评估

• 作者: 刘伟 向妍 周玮 李都悦 黄伊子
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: RNA二级结构 PDB数据库 二级结构预测 准确性
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 研究快报
• 页码范围: 35-39
• 页数: 5页
• 分类号: Q74
• 字数: 3266字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2015.01.07

摘要

随着21世纪分子生物学研究的蓬勃发展，RNA二级结构预测成为其中一项重要内容。由于RNA二级结构预测的准确性最为关键，因此寻找高精度且易操作的二级结构预测工具显得非常重要。本文选取三种简单且易操作的二级结构预测软件，先基于PDB数据库收录的318个RNA发夹序列进行二级结构预测，进而通过比较预测结果与实验测定结果进行软件预测性能评估。比较结果显示，RNAstructure为三个软件中性能最优的RNA二级结构预测软件。