Mg2+依赖性蛋白磷酸酶1δ的生物信息学分析

• 作者: 刘安 刘畅
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: Mg2+依赖性蛋白磷酸酶1δ 生物信息学 肝癌 预后标志物 功能
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 249-254
• 页数: 6页
• 分类号: Q71
• 字数: 3505字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.201705010

摘要

Mg2+依赖性蛋白磷酸酶1δ(protein phosphatase magnesium-dependent 1δ,PPM1D)作为肝癌潜在的预后标志物和治疗靶点,其致癌机制和预后价值仍未完全阐明.为了全面认识PPM1D,使用生物信息学方法,对PPM1D蛋白的序列同源性、组织表达、亚细胞定位、理化性质、 空间结构及蛋白质相互作用网络进行分析.结果表明:人PPM1D基因编码605个氨基酸组成的多肽,与物种进化程度一致,属于PP2C蛋白超家族,是碱性不稳定的亲水蛋白,无信号肽和跨膜区域;PPM1D蛋白主要定位于细胞核内,其主要二级结构为随机卷曲,存在磷酸化、乙酰化、甲基化和泛素化位点,与PPM1D相互作用的蛋白主要是细胞周期检查点蛋白和细胞损伤修复相关蛋白.根据分析结果阐述了PPM1D蛋白与癌症的相关性以及PPM1D蛋白作为癌症标志物的理论基础,为进一步研究该蛋白及其参与的信号通路提供一定的借鉴和参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘畅	长治医学院中心实验室	7	5	1.0	1.0
2	刘安	长治医学院附属和济医院医务科	12	10	2.0	2.0