保护品种云茶1号茶树全长转录组测序分析

• 作者: 夏丽飞 孙云南 宋维希 朱兴正 田易萍 蒋会兵 陈林波
• 来源期刊: 茶叶科学
• 学科: 农学
• 关键词: 云茶1号 全长转录组 基因分析 功能注释
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 页码范围: 193-201
• 页数: 9页
• 分类号: S571.1|S324
• 字数: 5725字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-369X.2018.02.011

摘要

为探讨云茶1号茶树品种优异性状的遗传基础,采用 PacBio 平台进行全长转录组测序,最终获得Polished consensus序列213389个,预测到CDS有223120个,检测到195062个SSR位点.在NR数据库有170264个同源序列比对到980个物种;有103124个在KOG数据库得到注释,根据其功能各分为26类;有65524个得到GO注释分为细胞组分、分子功能及生物学过程等三大类的55个功能组;根据KEGG数据库, 105972个得到了注释,涉及到216个代谢途径分支,包括茶叶品质、活性物质代谢以及抗逆等相关基因等;还预测到隶属于60个转录因子家族的转录因子有5785个.这些结果为进一步开展云茶1号茶树特异性状基因的标记性引物开发、遗传研究以及品质形成和抗逆机制研究奠定了基础.