水稻线粒体丝氨酸羟甲基转移酶基因的电子克隆

• 作者: 冯英 刘庆坡 董辉
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻 线粒体丝氨酸羟甲基转移酶 电子克隆
• 年，卷（期）: 2005,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 5-9
• 页数: 5页
• 分类号: S511
• 字数: 4600字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2005.01.002

摘要

采用基于EST的电子克隆方法得到了一段长1611bp的cDNA序列,以此为信息探针搜索HTGs数据库,找到一个与之高度匹配的基因组DNA序列--OSJNBa0057G07克隆.用FGENESH分析该克隆中的联配区域得到一个包含14个外显子和13个内含子的基因.该基因位于水稻第3染色体物理图谱的136.0～137.6cM区域.推导的ORF编码498个氨基酸,经BLASTP搜索SWISS-PROT数据库和蛋白序列的亚细胞定位显示,该基因编码水稻的线粒体丝氨酸羟甲基转移酶(mSHMT).该基因受到EST序列的完全支持,其中不乏来自盐胁迫、稻瘟病菌侵染等逆境处理的EST序列,推测该基因与水稻对逆境的应答反应有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘庆坡	浙江大学农业与生物技术学院农学系	10	177	7.0	10.0
2	董辉	浙江大学农业与生物技术学院农学系	10	78	4.0	8.0
3	冯英	浙江大学农业与生物技术学院农学系	18	394	13.0	18.0