东方肉座菌EU7-22木聚糖酶和木糖苷酶基因克隆及生物信息学研究

• 作者: 刘健 蒋凤姣 邬小兵 龙传南 龙敏南
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 东方肉座菌 木聚糖酶 木糖苷酶 基因克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 研究快报
• 页码范围: 58-64
• 页数: 7页
• 分类号: Q343.1+5
• 字数: 5108字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2013.01.10

摘要

东方肉座菌EU7-22具有高产半纤维素酶的能力.根据已报道的同属里氏木霉及绿色木霉木聚糖酶,木糖苷酶相关基因序列,设计PCR引物扩增出东方肉座菌内切木聚糖酶(XYN Ⅰ,XYNⅡ)及β-木糖苷酶(β-BXL)基因.序列经NCBIBlast分析:东方肉座菌xyn Ⅰ基因与里氏木霉xynl基因(X69573.1)的同源性最高达到91％；xynⅡ基因与绿色木霉xyn2基因(EF079061)同源性最高达到93％；β-bxl基因与里氏木霉β-bxll基因(Z69257.1)的同源性最高达到94％.生物信息学分析表明内切木聚糖酶Ⅰ和Ⅱ均属于糖基水解酶家族11,N末端前19个氨基酸均为信号肽.内切木聚糖酶Ⅰ分子量为24.13kD,等电点为7.87,含有3个糖基化位点；内切木聚糖酶Ⅱ分子量为24.44 kD,等电点为4.86,含有1个糖基化位点；β-木糖苷酶属于糖基水解酶家族3,分子量为87.27 kD,等电点为5.49,N末端前20个氨基酸为信号肽,含有8个糖基化位点.利用SWISS-Model对木聚糖酶,木糖苷酶蛋白质三级结构进行了预测和模拟.对木聚糖酶和木糖苷酶基因及其编码蛋白质的生物信息学分析,为进一步研究这些基因的表达与调控、构建高效利用纤维素组份的工程菌株奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邬小兵	厦门大学生命科学学院	31	288	7.0	16.0
2	龙敏南	厦门大学能源研究院	64	771	14.0	26.0
6	刘健	厦门大学能源研究院	19	51	4.0	6.0
7	龙传南	厦门大学能源研究院	5	19	3.0	4.0
8	蒋凤姣	厦门大学能源研究院	1	2	1.0	1.0