版纳微型猪近交系CD46基因克隆、序列及组织表达分析

• 作者: 曾养志 潘伟荣 王淑燕 王配 秦彩艳 苗永旺 霍金龙
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 补体调节蛋白基因CD46 版纳微型猪近交系 生物信息学 组织表达
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 249-256
• 页数: 8页
• 分类号: Q78
• 字数: 6211字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2014.04.03

摘要

根据猪NM_213888及EST序列,设计特异引物扩增BMI CD46基因,并进行克隆、测序和生物信息学分析。同时应用半定量RT-PCR技术对BMI 30个重要组织进行表达谱分析。获得了BMI CD461092 bp的编码区序列( GenBank登录号：KJ513478),编码363个氨基酸。分析表明,CD46蛋白质分子量( Mw)为39.60 kD,等电点( pI)为5.39,存在4个保守域和1个跨膜结构域,N端有信号肽序列；其N末端疏水,C末端亲水；亚细胞定位显示,该蛋白位于细胞周质的概率是56.7%。活性位点分析表明,BMI CD46蛋白有6类活性位点。系统进化分析表明,BMI与牛的亲缘关系最近。 BMI 30种组织表达分析表明, CD46基因在十二指肠中高表达；在睾丸、胸腺、甲状腺、附睾、肺、淋巴结、空肠、回肠、结肠、小脑及舌下腺中中度表达；在颌下腺、肝、肾上腺、盲肠、直肠、食管、垂体及脑干中低表达；在心、脾、肾、肌肉、胰脏、胃、皮肤、大脑、下丘脑及脊髓中不表达。该结果为进一步研究基因功能奠定基础。