甜菜基因组SSR标记特征分析

• 作者: 刘乃新 刘蕊 吴玉梅 董玉飞
• 来源期刊: 中国甜菜糖业
• 学科: 农学
• 关键词: 甜菜 基因组SSR GO分析
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 5-11
• 页数: 7页
• 分类号: S566.3
• 字数: 3859字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-0551.2019.03.002

摘要

简单序列重复(SSR)标记在甜菜遗传和应用研究中得到了广泛的应用,但在甜菜中应用有限.甜菜是世界上重要的糖料作物之一,因此需要开发更多的SSR标记.本研究对甜菜全基因组中简单重复简单重复序列(SSR)进行了鉴定.甜菜基因组共有174218个SSR位点,平均分布频率为463/MB.在甜菜的SSR序列中,五核苷酸(33.32％)＞三核苷酸(31.80％)＞二核苷酸(20.37％)＞六核苷酸(12.51％)＞四核苷酸(2.00％).在所设计的27649对引物中,18274对可以特异性扩增,是SSR标记物的37倍.甜菜中含有SSR的蛋白质编码基因与细胞过程、代谢过程、刺激反应和生物调控有关.我们的研究结果将为进一步开发新的SSR标记提供依据,这些标记在甜菜遗传研究的许多方面具有重要价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘乃新	黑龙江大学农作物研究院	12	7	2.0	2.0
3	吴玉梅	黑龙江大学农作物研究院	21	43	3.0	6.0
4	董玉飞	黑龙江大学生命学院	1	0	0.0	0.0