Halogranum amylolyticum TNN58全基因组测序及PHBV代谢途径分析

• 作者: 薛燕芬 赵有玺 饶志明 马延和
• 来源期刊: 食品与生物技术学报
• 学科: 生物学
• 关键词: PHBV 基因组 解淀粉盐颗菌
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 572-579
• 页数: 8页
• 分类号: Q789
• 字数: 5194字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-1689.2018.06.002

摘要

解淀粉盐颗菌TNN58(Halogranum amylolyticum TNN58)是一株极端嗜盐古菌,它可以利用葡萄糖积累3HV摩尔分数高达20％的PHBV.首次通过鸟枪法对H.amylolyticum TNN58进行了全基因组测序,利用Velvet软件进行组装,得到32个支架序列,整个基因组大小约为4.71Mb,测序深度为218X通过对基因组数据进行分析,发现该菌株PHA合酶由phaE和phaC两个亚基组成,存在4条3-HV的供应途径,同时发现该菌株不存在乙醛酸循环途径,但存在甲基天冬氨酸循环途径作为乙酸盐的回补利用途径.本研究的结果为揭示H.amylolyticum TNN58的PHBV合成机制和后续的功能基因组学研究的提供了数据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马延和	中国科学院微生物研究所	59	805	14.0	26.0
2	饶志明	江南大学工业生物技术教育部重点实验室	107	599	12.0	20.0
3	薛燕芬	中国科学院微生物研究所	17	372	11.0	17.0
4	赵有玺	江南大学工业生物技术教育部重点实验室	22	93	5.0	9.0