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生物信息学
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China Journal of Bioinformatics
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本刊是由哈尔滨工业大学主办的生物信息及相关领域的国内外公开发行的学术刊物，报道我国生物信息技术研究开发的重要成果和国内外生物信息技术及其产业化最新进展。
主办单位：
哈尔滨工业大学
ISSN：
1672-5565
CN：
23-1513/Q
出版周期：
季刊
邮编：
150001
地址：
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： 蛋白质结构预测是现代计算生物领域最重要的问题之一,而蛋白质二级结构预测是蛋白质高级结构预测的基础.目前蛋白质二级结构的预测方法较多,其中SVM方法取得了较高的预测精度.重在阐述使用SVM用于...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： DNA的电学性质关系到生命信息静态的存储和动态的释放,因此一直备受关注.在一种紧束缚模型的基础上,研究了DNA的电传输性质,并分析了DNA 的导电性的生物意义.在特定的传导距离下,可以利用导...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： 已有研究证明,HIV整合位点的选择, 与宿主基因组功能和染色体结构特性之间存在着紧密的联系,但是具体的选择机制还不明确.使用聚类分析、特征提取、分类分析等生物信息学方法,对HIV整合位点序列...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： Dof转录因子家族在植物生长发育和基因表达调控过程中具有重要的作用,本文利用公布的玉米基因组草图数据,利用生物信息学方法对玉米全基因组Dof基因的结构、系统进化关系和保守motif进行了分析...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： 基于蛋白质结构字母的预测和分析方法,一个必然的步聚,是将目标蛋白质离散成结构字母序列.本文在对蛋白质结构字母序列空间,及其最小根均方偏差变化,穷举分析的基础上,提出了一种新的蛋白质结构字母序...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： 目前评价蛋白质二级结构预测方法主要考虑预测准确率,并没有充分考虑方法自身参数对方法的影响.本文提出一种新型评价方法,将内在评价与外在评价相结合评价预测方法的优劣.以基于混合并行遗传算法的蛋白...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： 描述了细胞色素C(CytC)从线粒体释放的机制及其在细胞凋亡中的作用,主要阐述了细胞凋亡信号转导途径中的线粒体-CytC途径及AIF途径;CytC在细胞凋亡中的作用及介导细胞凋亡的方式.探讨...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： RNAi是指在特定因子的作用下,由导入细胞内的双链RNA(dsRNA)降解成的约22nt左右的siRNA.是近年来发现的可被人工诱导的一种生物体自身所具有的基因沉默现象.因为其相对于其他类似...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： 支持向量回归机(Support vector regressio,SVR)模型的拟合精度和泛化能力取决于其相关参数的选择,其参数选择实质上是一个优化搜索过程.根据启发式广度优先搜索(Heur...
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10. 基于组学数据构建基因调控网络刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： 在生命体内,基因以及其它分子间相互作用形成复杂调控网络,生命过程都是以调控网络的形式存在,如从代谢通路网络到转录调控网络,从信号转导网络到蛋白质相互作用网络等等.因此,网络现象是生命现象的复...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： 基因本体论是关于基因和蛋白质知识的标准词汇,也是今后实现各种与基因相关的数据统一、数据转换、数据挖掘的基础.本文通过分子功能基因本体论比较了不同模式生物基因产物分子功能分布的异同.结果发现:...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： 以火炬松热胁迫cDNA文库的EST序列为材料,对EST序列进行聚类、拼接等处理后,再进行Blast同源比对以及基因GO注释分析.研究结果如下:从Forest TreeDB数据库中下载了火炬松...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： 对未知蛋白的功能注释是蛋白质组学的主要目标.一个关键的注释是蛋白质亚细胞定位的预测.本文应用离散增量结合支持向量机(ID_SVM)的方法,对阳性革兰氏细菌蛋白的5类亚细胞定位点进行预测.在独...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： 从拓扑结构的角度分析生化反应网络是生物信息学研究中的一个热点问题.通过将两种传统的途径分析方法(基元模式和极端途径)与Petri网的T不变量分析进行了比较,结果表明:它们本质上是一致的,但是...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： 蛋白质折叠规律研究是生命科学重大前沿课题,折叠分类是蛋白质折叠研究的基础.目前的蛋白质折叠类型分类基本上靠专家完成,不同的库分类并不相同,迫切需要一个建立在统一原理基础上的蛋白质折叠类型数据...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： 随着新一代测序技术的发展,新的拼接算法应运而生.介绍了目前国际上广泛认可的几种新的拼接算法的基本原理与具体步骤,分析每种算法的优缺点以及适用范围.用Helicobacter acinonyc...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： 为了研究CpG岛产生和消失机制以及位于基因启动子区域外的CpG岛保守性等问题,我们通过序列比对和进化保守性分析等方法,分析在人类和小鼠中保守的基因上的CpG岛.结果显示已有保守序列的突变以及...
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18. 厌氧性粘菌基因组中密码对的使用刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： 分析了厌氧性粘菌(Anaeromyxobacter_dehalogenans_2N-C)基因组中密码对的使用,发现其全基因组中有5.2%的密码对模式是缺失的.分析结果表明其密码对的偏好至少可...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： 近年来对生物医学文献的文本挖掘在功能基因组学研究中得到了广泛开展.为了更好的检索MEDLINE摘要,本文介绍利用Unix文本过滤命令实现了对摘要的自动下载和更新.同时,对癌基因表达数据,如癌...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： 德氏乳杆菌保加利亚亚种(Lactobacillus delbrueckii subsp.bulgaricus)是最具经济价值的乳酸菌之一,在世界上广泛应用于酸奶和其它发酵乳生产.当前对该菌的...
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21. 民族药用植物指纹数据库的构建研究刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： 通过对四川省时采集的民族药用植物标本进行基因和化学指纹图谱、药用价值、民族传统利用等信息的整理,用SQL Server 2000建立一个民族药用植物指纹的开放式关系数据库初步框架.该数据库重...
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22. 细胞色素c蛋白序列分析与结构比较刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： 首先以马心细胞色素c(Horse Cyt c)蛋白的氨基酸序列为查询序列,利用生物信息学方法进行相似性搜索,获得了一系列细胞色素c(Cyt c)蛋白的氨基酸序列,然后对Cyt c蛋白进行了多...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： 白藜芦醇合酶(resveratrol synthetic enzyme,RS)是植物白藜芦醇合成途径中的关键酶,利用已知的葡萄RS基因(AF274281)序列设计并合成了一对引物,以蛇白蔹基...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要： 科学工作者在分析EST-SSR特性时需要许多手工操作,这是一个耗时而又容易出错的工作.本文介绍了以Excel平台来计算核苷酸数目、计算特定碱基数量和比例、合并SSR重复基元、筛选基元的重复记...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年3期页码:摘要：
生物信息学基本信息
| 刊名 | 生物信息学 | 主编 | 任南琪 |
| 曾用名 | |||
| 主办单位 | 哈尔滨工业大学 | 主管单位 | 中华人民共和国工业和信息化部 |
| 出版周期 | 季刊 | 语种 |
chi
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| ISSN | 1672-5565 | CN | 23-1513/Q |
| 邮编 | 150001 | 电子邮箱 | itgene@sohu.com |
| 电话 | 0451-86414135；0451-86417711（吴永英） | 网址 | http://swxxx.alljournals.cn/ch/index.aspx |
| 地址 | 黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼 |
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