结合分子相似性、药效团和分子对接筛选新的HIV-1蛋白酶抑制剂

• 作者: 刘澍楠 唐国荣 汪滢
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 医学
• 关键词: HIV-1蛋白酶抑制剂 分子相似性 药效团 分子对接
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 所属期刊栏目: 研究快报
• 页码范围: 244-250
• 页数: 7页
• 分类号: R91
• 字数: 3276字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2015.04.07

摘要

结合分子相似性、药效团和分子对接建立兼顾计算效率和预测准确度的HIV?1蛋白酶抑制剂筛选方法。首先通过对现有HIV?1蛋白酶抑制剂分子进行相似性分析，选取代表性的HIV?1蛋白酶抑制剂作为模板分子，构建和优化药效团模型，并从1万个化合物中优先筛选出500个化合物。而后采用分子对接方法进一步考察化合物与HIV?1蛋白酶结合情况，得到4个新的活性候选化合物，并进行其结合自由能计算和抗突变性分析。结果表明新候选化合物ST025723和HIV?1蛋白酶表现出较好的相互作用和抗突变性，具有深入研究的价值，同时也证明分子相似性、药效团和分子对接相结合能够快速有效地发现新颖活性候选化合物。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	唐国荣		15	19	3.0	4.0
2	刘澍楠		9	18	3.0	4.0
3	汪滢		2	29	2.0	2.0