比较基因组揭示广西酸菜乳杆菌碳水化合物活性酶谱

• 作者: 彭明芳 李培骏 单杨 陈玉秋 杨岱峻 雷丽嫦 黄芝辉 余孔新
• 来源期刊: 食品与发酵工业
• 关键词: 乳杆菌 碳水化合物活性酶 植物多糖 比较基因组 酸菜
• 年，卷（期）: 2021,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 68-73
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13995/j.cnki.11-1802/ts.025057

摘要

微生物中的碳水化合物活性酶(carbohydrate active enzymes,CAZymes)具有降解植物组织的作用,相对于真菌,目前对于乳杆菌的CAZymes研究还比较少.该研究从广西酸菜中筛选获得了3株产CAZymes的乳杆菌,并通过二代测序技术比较其编码基因.16S rRNA测序结果表明3株乳杆菌分别是Lactobacillus brevis DC4,Lactobacillus planta-rum GLKK1和GLKK2;经液态发酵后,L.brevis DC4产果胶酶、纤维素酶和半纤维素酶分别为(0.40±0.01)、(0.04±0.01)和(0.19±0.01)U/mL.乳杆菌DC4、GLKK1和GLKK2编码序列分别有2615、3355以及3270个,COG注释均集中在碳水化合物转运与代谢、转录、氨基酸转运与代谢等;CAZymes注释均集中在糖苷水解酶(glycoside hydrolases,GHs)、糖基转移酶(glycosyl transferases,GTs)和碳水化合物酯酶(carbohydrate esterases,CEs).3株乳杆菌包含17种CAZymes共有基因,包括纤维素、半纤维素、果胶、淀粉水解酶和酯酶.此外,L.brevis DC4菌株有10种特有基因,包括GH8、GH30和GH51家族,而L.plantarum GLKK1和L.plantarum GLKK2包含7种特有基因,包括GH39、GH13、CE2和GH78家族.