生物信息学期刊
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生物信息学

China Journal of Bioinformatics

CSTPCD

影响因子 0.3945
本刊是由哈尔滨工业大学主办的生物信息及相关领域的国内外公开发行的学术刊物,报道我国生物信息技术研究开发的重要成果和国内外生物信息技术及其产业化最新进展。
主办单位:
哈尔滨工业大学
ISSN:
1672-5565
CN:
23-1513/Q
出版周期:
季刊
邮编:
150001
地址:
黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼
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  • 作者: 任鄄胜 吕启明 李仕贵 王玉平 肖培村 赵慧霞 陈勇
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2010年2期
    页码:  91-97
    摘要: 利用模糊搜索的方法,在TIGR水稻日本晴基因组数据库(TIGR Rice Genome Annotation - Release 5)中识别出565个编码抗病蛋白质的同源序列;利用识别出56...
  • 作者: 张小刚 张波 王建飞 申伟科 秦向东 葛昆 钟理
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2010年2期
    页码:  98-103
    摘要: 鉴定癌症表达谱的特征基因集合可以促进癌症类型分类的研究,这也可能使病人获得更好的临床诊断?虽然一些方法在基因表达谱分析上取得了成功,但是用基因表达谱数据进行癌症分类研究依然是一个巨大的挑战,...
  • 作者: 欧阳玉梅
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2010年2期
    页码:  104-109
    摘要: 随着DNA芯片技术的广泛应用,基因表达数据分析已成为生命科学的研究热点之一.概述基因表达聚类技术类型、算法分类与特点、结果可视化与注释;阐述一些流行的和新型的算法;介绍17个最新相关软件包和...
  • 作者: 张景祥 徐振源 赵晓兵
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2010年2期
    页码:  110-113
    摘要: 根据DNA序列的'终止密码子'及其'逆补终止密码子'的分布情况,给出一种新的DNA序列向量的构建方法,运用Shannon熵相关理论,对Jensen-Shannon离散量和KL离散量进行了修正...
  • 作者: 唐静仪 宋晓婕 杨中奇 樊晓霞 王万军
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2010年2期
    页码:  114-117
    摘要: 用生物信息学方法对拟南芥叶状子叶(LEC)基因的核苷酸序列以及推导氨基酸序列的组成、功能结构域、亲水性等进行了分析.结果表明,拟南芥的LEC 蛋白为位于细胞核中的亲水性不稳定蛋白;通过对LE...
  • 作者: 尹京苑 郭源远
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2010年2期
    页码:  118-123
    摘要: 采用HMMER与BLAST相结合的方法确定拟南芥,水稻和杨树三种模式植物全基因组JMJC蛋白基因个数分别为21,20,24,并对其染色体定位,基因结构,保守功能域进行了系统分析,在系统进化分...
  • 作者: 盛嘉 郑思远 郝沛
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2010年2期
    页码:  124-126,133
    摘要: 药物靶标发现是目前生物学研究领域的热点和难点问题.从已有药物靶标中寻找规律可以为新靶标的发现总结规律,提供依据.随着功能基因组学的发展,这种组学数据的积累为这一问题的研究提供了契机.本文研究...
  • 作者: 张静 田瑞琴 胡俊
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2010年2期
    页码:  127-133
    摘要: 真核基因的转录调控是后基因组时代研究的主要问题之一,其基础是认识DNA上转录因子结合位点(模体)及分布状况.基于马尔可夫链模型对酵母核糖体蛋白基因上游启动子序列中模体出现次数进行统计,利用Z...
  • 作者: 屈武斌 张成岗 李煞骀 杭兴宜 申志勇
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2010年2期
    页码:  134-138,141
    摘要: 聚合酶链式反应(PCR)虽已广泛用于分子生物学研究中,然而PCR实验中的非特异性产物问题将直接影响PCR的效率,在多重PCR实验中更是如此.为了最大限度地降低非特异性产物的出现率,同时避免用...
  • 作者: 周贵良 梁敏玲 洪来法 郑柳城 陈转贤
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2010年2期
    页码:  139-141
    摘要: 利用NCBI提供的RefSeq序列,通过BLAT、Sim4和自主开发的剪接比对程序Ealter1.0对人类RefSeq转录本进行外显子预测,根据预测的外显子信息,采用自主开发SYBR Gre...
  • 作者: 刘选明 周祎 易丽萍 李明福 谭钟扬 陈洪俊
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2010年2期
    页码:  142-146,149
    摘要: 现有92株芜菁花叶病毒(TuMV)的全基因组序列已在GenBank报道,据分析报道其中58株不含重组序列.利用系统聚类法对92株TuMV的全基因组序列和58株TuMV全基因组序列的相对密码子...
  • 作者: 曹波 杨跃 黄晓韵
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2010年2期
    页码:  147-149
    摘要: 利用SAS软件对GEO的一个肺癌芯片实验进行挖掘.采用非参数检验,判别分析和回归分析对该芯片实验中14个核受体的表达信息进行分析.结果表明,在0.05显著性水平下,ER1、VDR、 RARα...
  • 作者: 张秀清 梁群 汪建 王琪
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2010年2期
    页码:  150-152,155
    摘要: 单碱基突变的筛选和分类是SNP分析的基础.为解决手工进行突变位点挖掘工作的困难,编写了VersusSNP软件.它可以解析并过滤序列比对结果,并根据突变类型将位点加以分类,以图形界面呈现给用户...
  • 作者: 李彬彬 钟复光 黄培春
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2010年2期
    页码:  153-155
    摘要: 对线粒体DNA(mtDNA)序列进行多态性分析,将有利于从母系遗传的角度研究各人群的源流、迁移以及亲缘关系等情况.探讨利用Internet共享生物学软件对各种生物样本mtDNA高变区进行序列...
  • 作者: 徐振源 蒋丽丽 高洁
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2010年2期
    页码:  156-160,164
    摘要: 利用DNA序列的混沌游戏表示(chaos game representation,CGR),提出了将2维DNA图谱转化成相应的类谱格式的方法. 该方法不仅提供了一个较好的视觉表示,而且可将D...
  • 作者: 伍宁丰 王立群 许丽
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2010年2期
    页码:  161-164
    摘要: 生物信息学的发展产生了越来越多的数据库和生物学软件,研究人员在应用这些生物学工具处理实验数据时需要大量的时间解决数据格式转换和管理等问题.本文介绍了一种交互式的基于网络的新一代生物信息学分析...
  • 作者: 刘胜毅 惠丰立 柯涛 柴国华 毛晗 董彩华
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2010年2期
    页码:  165-170,174
    摘要: 利用生物信息学方法,收集整理GenBank数据库中截至2008年5月收录的油料作物油菜、花生、芝麻、大豆、向日葵、蓖麻、亚麻、棕榈等八种油料作物的表达序列标签(EST)序列信息,共获得1,1...
  • 作者: 刘强 刘毅慧 成金勇 李保朋 王丽娟
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2010年2期
    页码:  171-174
    摘要: 通过评价31磷磁共振波谱(31Phosphorus Magnetic Resonance Spectroscopy,31P-MRS)来辨别三种诊断类型:肝细胞癌,正常肝和肝硬化.运用反向传输...
  • 作者: 徐利娟 穆松 钟金城 陈智华
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2010年2期
    页码:  175-179,186
    摘要: 流行性感冒病毒是一种造成人类及动物患流行性感冒的RNA病毒,它造成急性上呼吸道感染,并由空气迅速传播,在世界各地常有周期性的大流行.根据该病毒的基因组CDS序列,探讨了基因组序列密码子的使用...
  • 作者: 罗佳 金锋
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2010年2期
    页码:  180-186
    摘要: 为阐明自杀行为的机制,在众多的自杀候选基因中,本文着重对候选基因5-HT2Α受体基因进行了生物信息学分析,结果支持候选基因及其编码蛋白质参与自杀行为的生理生化过程,为自杀行为受基因、环境的共...

生物信息学基本信息

刊名 生物信息学 主编 任南琪
曾用名
主办单位 哈尔滨工业大学  主管单位 中华人民共和国工业和信息化部
出版周期 季刊 语种
chi
ISSN 1672-5565 CN 23-1513/Q
邮编 150001 电子邮箱 itgene@sohu.com
电话 0451-86414135;0451-86417711(吴永英) 网址 http://swxxx.alljournals.cn/ch/index.aspx
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