基于氨基酸和二肽组成的蛋白质四级结构分类研究

• 作者: 张振慧 王勇献 王正华
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 工学
• 关键词: 氨基酸组成 二肽组成 四级结构
• 年，卷（期）: 2007,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 49-52
• 页数: 4页
• 分类号: Q617|TP391
• 字数: 3453字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2007.02.001

摘要

基于最近邻居算法,从蛋白质一级序列出发,利用蛋白质序列氨基酸组成、二肽组成以及混合组成方法对蛋白质单聚体、二聚体、三聚体、四聚体、五聚体、六聚体和八聚体进行分类研究.结果表明:采用二肽组成编码方法的预测效果最好,Jackknife检验和独立测试集检验的总体预测精度分别达到90.83%和95.48%,比相同数据集上基于伪氨基酸组成和组分耦合预测的方法提高了12和15个百分点;特别是对于五聚体蛋白,预测精度分别提高了90和50个百分点;说明二肽组成对于蛋白质四级结构分类研究是一种非常有效的特征提取方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王正华	国防科技大学计算机学院并行与分布处理国家重点实验室	72	600	12.0	20.0
2	王勇献	国防科技大学计算机学院并行与分布处理国家重点实验室	26	140	7.0	11.0
3	张振慧	国防科技大学理学院数学与系统科学系	17	82	6.0	8.0