茶小绿叶蝉CYP 6A14基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 吴光远 张辉 曾明森 李慧玲 李良德 王定锋
• 来源期刊: 茶叶学报
• 学科: 农学
• 关键词: 茶小绿叶蝉 转录组 CYP6A14基因 校对 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 页码范围: 1-5
• 页数: 5页
• 分类号: S435.711
• 字数: 3715字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-4872.2018.01.002

摘要

细胞色素P450(Cytochrome P450,CYP)是一类超家族基因,该基因对农药具有代谢解毒作用,致使昆虫产生抗药性,而CYP6是整个CYP家族中最重要的一族.本研究从前期获得的茶小绿叶蝉转录组数据库中筛选出了CYP6A14基因,通过RT-PCR对该基因的序列进行了校对,并运用一系列相应软件对该基因的生物信息学进行了分析.RT-PCR结果表明,所获得的基因片长1696 bp,其中包含21 bp的5′端序列,1467 bp的编码区序列(编码488个氨基酸)和208 bp的3′端序列.进化树分析结果表明,该基因与赤拟谷盗亲缘关系最近,与温室希蛛的亲缘关系最远.氨基酸比对结果表明,该基因编码的氨基酸与其他物种的保守性较差.三级结构模拟结果表明,CYP6A14蛋白主要由α螺旋组成.功能域预测结果表明,该基因具有一个p450蛋白域(Pfam:p450),而无信号肽(signal peptides)和跨膜结构(transmembrane structure).该研究获得了茶小绿叶蝉CYP 6A14基因的核苷酸序列,明确了该基因的基本生物学信息,为后续研究茶小绿叶蝉CYP 6A14的分子功能奠定了基础.