按蚊防御素基因家族转录模式和启动子的生物信息学分析

• 作者: 刘红美 吴建伟
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 防御素 冈比亚按蚊 转录模式 转录因子
• 年，卷（期）: 2008,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 109-112
• 页数: 4页
• 分类号: Q969.92
• 字数: 4050字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2008.03.005

摘要

运用生物信息学方法分析冈比亚按蚊(Anopheles gambiae)中防御素基因家族的表达模式和启动子保守区.在ENSEMBL数据库中搜索防御素基因家族序列,然后将基因编号输入angaGEDUCI数据库中进行分析.结果在冈比亚按蚊中存在有4个防御素基因的异构体分子,其中DEF1基因表达模式与其它3个基因存在明显差异.4个防御素基因启动子序列都存在AP-1、CATA-1、CCN4、GR、HNF-3B、TFIID 6个转录因子的识别结合位点,表明这6个转录因子是冈比亚按蚊防御素基因家族表达调控所必需的.值得注意的是,DEF1基因启动子序列中存在与性别决有关的SOX proteins转录因子的结合位点.暗示DEF1基因的转录调控可能与性别分化有关;而在DEF2基因启动子序列中存在有热激因子(HSTF)的识别结合位点,表明热刺激会调控DEF2基因的表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴建伟	贵阳医学院寄生虫学教研室	83	698	14.0	21.0
2	刘红美	贵阳医学院医学生物技术教研室	26	156	6.0	11.0