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生物信息学
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China Journal of Bioinformatics
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本刊是由哈尔滨工业大学主办的生物信息及相关领域的国内外公开发行的学术刊物，报道我国生物信息技术研究开发的重要成果和国内外生物信息技术及其产业化最新进展。
主办单位：
哈尔滨工业大学
ISSN：
1672-5565
CN：
23-1513/Q
出版周期：
季刊
邮编：
150001
地址：
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1. 双绕蛋白质的分类与识别刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年1期页码:摘要： 蛋白质折叠识别是蛋白质结构研究的重要内容.双绕是α/β蛋白质中结构典型的常见折叠类型.选取22个家族中序列一致性小于25%的79个典型双绕蛋白质作为训练集,以RMSD为指标进行系统聚类,并对...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年1期页码:摘要： 通过生物信息学方法对拟南芥基因组序列进行搜索,发现两个新的非编码小分子RNA基因,分别命名为AthsnoR206a和AthsnoR206b.它们相距约170nt,位于蛋白质基因间隔区.MFO...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年1期页码:摘要： 有关蛋白质功能的研究是解析生命奥秘的基础,机器学习技术在该领域已有广泛应用.利用支持向量机(support vector machine,SVM)方法,构建一个预测蛋白质功能位点的通用平台....
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年1期页码:摘要： 基于Homin的基因共表达网络的比较分析,发现人类基因共表达网络和蛋白质相互作用数据之间存在一定的相关性.采用基因本体论对这两个网络重叠区域进行基因分类后发现,这些编码的蛋白质主要集中在对刺...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年1期页码:摘要： 支持向量机是在统计学习理论基础上发展起来的一种新的机器学习方法,在模式识别领域有着广泛的应用.利用基于支持向量机模型的~(31)P磁共振波谱数据对肝脏进行分类,区别肝细胞癌,肝硬化和正常的肝...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年1期页码:摘要： 基因本体(GO)数据库为基因提供了统一的注释,有效地解决了不同数据库描述相同基因的不一致问题.但是,根据基因注释如何比较基因的功能相似性,这个问题仍然没有得到有效解决.本文提出一种新的基因注...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年1期页码:摘要： Z曲线是DNA序列信息的一种几何学表示形式.利用Z曲线坐标所对应的生物学含义,可以对DNA序列的生物信息进行系统分析.本文对40株自测序和从GenBank下载的新城疫病毒(NDV)全基因组序...
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8. 蛋白质共进化分析研究进展刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年1期页码:摘要： 一些对蛋白质活性很重要的残基在进化过程中是高度保守的,另有一些残基通过共进化来维持蛋白质结构和功能上的稳定.由于共进化残基分析可在未知蛋白质结构时,仅依据序列推断残基间的相互作用,因此在蛋白...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年1期页码:摘要： 利用生物信息学方法分析白桦4CL蛋白的氨基酸组成、等电点、疏水/亲水区、跨膜区及二级结构等蛋白质性质;并同拟南芥、水稻和毛白杨的4CL蛋白进行对比,进行同源性分析;利用生物信息学软件对其空间...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年1期页码:摘要： 利用来自Forest TreeDB数据库中热胁迫cDNA文库ESTs聚类、拼接组装的Unigene以及基因GO注释,得到了假定的火炬松DREB1基因,全长1 293bp,具有完整的蛋白编码框...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年1期页码:摘要： 为了深入研究猪胸膜肺炎放线杆菌(Actinobacillus pleuropneumonie,App)转铁结合蛋白基因(Transferrin Binding Proteins,Tbp)的生...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年1期页码:摘要： 利用FreeBSD操作系统的文本过滤命令将NCBI的Genbank数据库的EST序列实现本地化导入到MySQL数据库中并能够进行更新,这利于对不同物种不同组织器官基因表达的分析.以水稻EST...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年1期页码:摘要： 偏头痛是临床上常见的多发性疾病,主要表现为一侧或双侧头部反复发作的搏动性疼痛,可伴有恶心、呕吐、视物异常等神经症状.关于偏头痛的发病机制研究尚无定论.偏头痛的发病机理一直受到人们的关注,近年...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年1期页码:摘要： 电子克隆提供了一种利用基因组数据库克隆新基因全长cDNA序列的策略.利用小鼠Irak-1基因编码序列(NM_008363)为种子序列进行电子克隆获得了牛Irak-1基因完整编码序列.然后,用...
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15. 生物序列比对算法的研究现状刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年1期页码:摘要： 序列比对是生物信息学研究的一个重要工具,它在序列拼接、蛋白质结构预测、蛋白质结构功能分析、系统进化分析、数据库检索以及引物设计等问题的研究中被广泛使用.本文详细介绍了在生物信息学中常用的一些...
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16. 生物实验信息管理模块建模技术研究刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年1期页码:摘要： 实验信息管理模块是生物实验室信息管理系统的核心,其设计的好坏直接关系到整个系统建设的成败.针对生物实验室实验流程灵活,数据流网络复杂等特点,研究设计了一套实验信息管理模块的模型,并将研究的模...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年1期页码:摘要： 蛋白质能量最小化是蛋白质折叠的重要内容.用于蛋白质折叠的新的杂合进化算法结合了交叉和柯西变异.基于toy模型的蛋白质能量最小化算例表明,这个新的杂合进化算法是有效的.
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年1期页码:摘要： 组建一个分两个阶段的分类器来进行蛋白质二级结构预测.第一阶段由支持向量机分类器组成,在第二阶段中使用第一阶段已预测的结果来进行贝叶斯判别.预测性能的改进表明了结合支持向量机和贝叶斯方法预测性...
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19. 我国生物信息产业的现状及问题分析刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年1期页码:摘要： 针对我国生物信息产业的现状及存在的问题进行分析,介绍了生物信息学以及生物芯片研究的现状和新技术、生物信息产业的发展,并对生物信息产业的知识产权保护问题进行了分析和讨论.对于今后如何发展我国生...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年1期页码:摘要： CpG岛和TATA框在基因表达调控方面具有重要的作用,本研究从EBI核酸数据库中下载经试验证实的果蝇启动子序列共计1 917条,对其中的CpG岛、GC碱基分布和TATA框进行了分析.预测果蝇...
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21. DNA的数进制分析刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年1期页码:摘要： 寻找控制生命活动的无形数据,对揭开生命的数控奥秘无疑具有十分重要的意义.通过对DNA中四种碱基进行排列组合的计算和分析,得出DNA可以构成2、4、10、12、16、20、24、35、64、2...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年2期页码:摘要： 利用模糊搜索的方法,在TIGR水稻日本晴基因组数据库(TIGR Rice Genome Annotation - Release 5)中识别出565个编码抗病蛋白质的同源序列;利用识别出56...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年2期页码:摘要： 鉴定癌症表达谱的特征基因集合可以促进癌症类型分类的研究,这也可能使病人获得更好的临床诊断?虽然一些方法在基因表达谱分析上取得了成功,但是用基因表达谱数据进行癌症分类研究依然是一个巨大的挑战,...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年2期页码:摘要： 随着DNA芯片技术的广泛应用,基因表达数据分析已成为生命科学的研究热点之一.概述基因表达聚类技术类型、算法分类与特点、结果可视化与注释;阐述一些流行的和新型的算法;介绍17个最新相关软件包和...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年2期页码:摘要： 根据DNA序列的'终止密码子'及其'逆补终止密码子'的分布情况,给出一种新的DNA序列向量的构建方法,运用Shannon熵相关理论,对Jensen-Shannon离散量和KL离散量进行了修正...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年2期页码:摘要： 用生物信息学方法对拟南芥叶状子叶(LEC)基因的核苷酸序列以及推导氨基酸序列的组成、功能结构域、亲水性等进行了分析.结果表明,拟南芥的LEC 蛋白为位于细胞核中的亲水性不稳定蛋白;通过对LE...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年2期页码:摘要： 采用HMMER与BLAST相结合的方法确定拟南芥,水稻和杨树三种模式植物全基因组JMJC蛋白基因个数分别为21,20,24,并对其染色体定位,基因结构,保守功能域进行了系统分析,在系统进化分...
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28. 药物靶标蛋白在蛋白网络中的分布刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年2期页码:摘要： 药物靶标发现是目前生物学研究领域的热点和难点问题.从已有药物靶标中寻找规律可以为新靶标的发现总结规律,提供依据.随着功能基因组学的发展,这种组学数据的积累为这一问题的研究提供了契机.本文研究...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年2期页码:摘要： 真核基因的转录调控是后基因组时代研究的主要问题之一,其基础是认识DNA上转录因子结合位点(模体)及分布状况.基于马尔可夫链模型对酵母核糖体蛋白基因上游启动子序列中模体出现次数进行统计,利用Z...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2010年2期页码:摘要： 聚合酶链式反应(PCR)虽已广泛用于分子生物学研究中,然而PCR实验中的非特异性产物问题将直接影响PCR的效率,在多重PCR实验中更是如此.为了最大限度地降低非特异性产物的出现率,同时避免用...
生物信息学基本信息
| 刊名 | 生物信息学 | 主编 | 任南琪 |
| 曾用名 | |||
| 主办单位 | 哈尔滨工业大学 | 主管单位 | 中华人民共和国工业和信息化部 |
| 出版周期 | 季刊 | 语种 |
chi
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| ISSN | 1672-5565 | CN | 23-1513/Q |
| 邮编 | 150001 | 电子邮箱 | itgene@sohu.com |
| 电话 | 0451-86414135；0451-86417711（吴永英） | 网址 | http://swxxx.alljournals.cn/ch/index.aspx |
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