基于Illumina MiSeq测序和传统可培养方法的洪湖鲊广椒乳酸菌多样性研究

• 作者: 李娜 崔梦君 马佳佳 雷炎 郭壮 张振东
• 来源期刊: 食品与发酵工业
• 关键词: 鲊广椒 高通量测序 传统可培养方法 乳酸菌 多样性
• 年，卷（期）: 2021,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 110-115,122
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13995/j.cnki.11-1802/ts.024337

摘要

为明确洪湖鲊广椒的乳酸菌多样性,从湖北省荆州市洪湖市采集了7份鲊广椒样品,分别采用传统可培养方法与Illumina MiSeq高通量技术对其进行多样性评价.高通量测序结果表明,硬壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)是鲊广椒样品中的优势细菌门,平均相对含量分别为77.78％、18.09％、1.74％和1.51％;优势菌属为乳杆菌属(Lactobacillus),海洋芽孢杆菌属(Oceanobacillus),盐单胞菌属(Halomonas),平均相对含量分别为67.97％,3.88％,3.47％.在分类操作单元(operational taxonomic units,OTU)水平上,有12个平均相对含量>1.0％的OTU,其中9个隶属于乳杆菌属.由此可见,该地区鲊广椒中主要含乳酸杆菌属.基于传统可培养分离方法表明,从鲊广椒样品中分离到的29株乳酸菌被鉴定为3个属和8个种,其中植物乳杆菌(L.plantarum)和福莱乳杆菌(L.futsaii)分别有10株与8株,是优势菌.与其他地区不一样的是,洪湖鲊广椒中除了植物乳杆菌,还含有较多的福莱乳杆菌.