生物信息学期刊
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生物信息学

China Journal of Bioinformatics

CSTPCD

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本刊是由哈尔滨工业大学主办的生物信息及相关领域的国内外公开发行的学术刊物,报道我国生物信息技术研究开发的重要成果和国内外生物信息技术及其产业化最新进展。
主办单位:
哈尔滨工业大学
ISSN:
1672-5565
CN:
23-1513/Q
出版周期:
季刊
邮编:
150001
地址:
黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼
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  • 作者: 岁品品 崔颖 王宏 邢旭东
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年1期
    页码:  1-6
    摘要: 为研究高通量的人类CD4+T细胞的核小体定位模式,使用迭代算法对核小体定位模式进行分类,并利用位置权重矩阵方法分别构建稳定核小体定位序列、动态核小体定位序列和连接区序列模型,通过十倍交叉验证...
  • 作者: 余晓丽 孙妍 王心倩 王文靖
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年1期
    页码:  7-12
    摘要: 以非结核分枝杆菌中的胞分枝杆菌、鸟分枝杆菌两个标准株为研究对象,以耻垢分枝杆菌mc2155和结核分枝杆菌H37Rv为对照,对其mmpL11同源基因进行序列分析,并对其蛋白质进行结构及功能预测...
  • 作者: 沈成才
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年1期
    页码:  13-18
    摘要: 台东苏铁是一种古老的裸子植物,有关苏铁的RNA编辑的研究很少。为此,我们分析了台东苏铁的RNA编辑位点和分布,为探究RNA编辑的功能和机制以及高等植物的起源和进化提供依据。本次以台东苏铁( ...
  • 作者: 刘振东 张华 张燕 王玉彩 赵颖馨
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年1期
    页码:  19-25
    摘要: 为探讨流体剪切力对内皮细胞micorRNAs表达的影响。采用旋转锥形圆盘剪切力系统对内皮细胞分别加载低(4 dyn/cm2)、中(10 dyn/cm2)和高(15 dyn/cm2)3种不同梯...
  • 作者: 张敏 张艳欣 杜鹏飞 杨鑫 王静 邹攀
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年1期
    页码:  26-30
    摘要: 目前,我国的肿瘤发病率为285.91/10万,平均每分钟有6人被诊断为恶性肿瘤,因此肿瘤的早期诊断的重要性显而易见。随着分子生物学、免疫学诊断技术的飞速发展,寻找肿瘤诊断和预后的特异性标志物...
  • 作者: 林娟 王晓锋 蔡伟文 许伟明 鄢仁祥
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年1期
    页码:  31-38
    摘要: G蛋白偶联受体( G protein?coupled receptor, GPCR)是含有七个跨膜螺旋的一类重要蛋白,是迄今为止发现的最大的多药物靶标受体超蛋白家族。例如,目前上市药物中有超...
  • 作者: 方刚
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年1期
    页码:  39-42
    摘要: 由于基因测序及DNA合成技术与工具的突破性进展,生物工程正在加速发展,导致合成生物学的出现。本文介绍了一种用于构建表达载体的合成生物学数据库。阐述了如何利用MySQL数据库管理系统( DBM...
  • 作者: 卢创新 周云 崔永霞 朱琰琰 罗执芬
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年1期
    页码:  43-48
    摘要: 传统的肺癌分子标记物探索通常基于基因组或者转录组研究,而基于蛋白质水平的肺癌分子标记物探索通常局限在低通量水平。质谱技术已经开始产生高通量的全局正常及癌症蛋白组。我们采用开源统计软件R对人类...
  • 作者: 宋德平 谌南辉
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年1期
    页码:  49-55
    摘要: 建立生命信息安全控制原理的理论性平台,由该平台的视野分析免疫学所涉及的诸多理论问题,譬如免疫记忆、免疫功能等方面,并针对性进行归纳以及绘制出相关图形,试图将免疫学理论中所呈现的纷繁复杂性的方...
  • 作者: 严志祥 操利超 李玲 陈凤珍
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年1期
    页码:  56-60
    摘要: 随着高通量测序技术的快速发展,下一代测序技术也迅速发展为生物领域中的主流技术,而理解下一代测序数据最重要的一步是比对。比对是进行后续生物信息分析的基石,也因此催生了很多比对软件。本文主要选取...
  • 作者: 刘港彪 王利 黄艳青
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年2期
    页码:  61-70
    摘要: 采用PCR方法从鮰爱德华菌基因组中扩增出外膜蛋白OmpLC基因,利用生物信息学相关软件和网络数据库,预测该基因编码产物的基本理化性质、亲疏水性、信号肽、跨膜性、二级结构、结构域及基序、以及三...
  • 作者: 张立虎 李冠 李思怡 赵莉
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年2期
    页码:  71-77
    摘要: 以甜瓜蔗糖转化酶基因序列为材料,研究甜瓜蔗糖转化酶基因密码子偏好性,为改良甜瓜风味与品质提供理论依据.运用在线分析软件CodonW对甜瓜蔗糖转化酶的编码序列(Coding sequence,...
  • 作者: 张学勇 简莹娜 马利青
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年2期
    页码:  78-83
    摘要: 对三种隐孢子虫(C.parvum IowaⅡ、Chominis TU502和C.muris RN66)钙依赖蛋白激酶(Calcium-dependent protein kinases,CD...
  • 作者: 庞瑞华 李永能 李琦华 杨明华 潘洪彬 王顺利 赵素梅 黄英
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年2期
    页码:  84-94
    摘要: 硒是人和动物生命必需的微量元素,硒的生物学功能是通过硒蛋白来实现的,硒蛋白P(Selenoprotein P,Sepp1)是机体含量最多的硒蛋白.利用生物信息学相关分析软件和比较基因组学的方...
  • 作者: 刘烨 杨林 梁明才 蔡继翔
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年2期
    页码:  95-99
    摘要: 单细胞凝胶电泳技术是被广泛使用的检测DNA损伤的技术,其具有灵敏度高、简便、经济、快速等各种优点.在近30年来,该技术广泛被应用于遗传毒理、环境监测、医学诊断等研究及各类实验证实方面.近些年...
  • 作者: 张春城 李晓琴
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年2期
    页码:  100-107
    摘要: 蛋白质折叠规律研究是生命科学重大前沿课题,折叠类型分类是蛋白质折叠研究的基础.构建BRD-like折叠类型模板数据库,建立了基于多模板的综合分类方法,并用于该折叠类型的分类.对实验集的12 ...
  • 作者: 丛培琳 张海玲 田庆彬
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年2期
    页码:  108-111
    摘要: 采用B/S架构设计与实现了一个生物化学口试训练系统.该系统利用C#语言进行开发,底层运用SQL server 2005数据库进行数据管理.在系统需求分析的基础上,进行了总体设计和详细设计,主...
  • 作者: 史小红
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年2期
    页码:  112-116
    摘要: 基于蛋白质二维HP模型提出改进的遗传算法对真实蛋白质进行计算机折叠模拟.结果显示疏水能量函数最小值的蛋白质构象对应含疏水核心的稳定结构,疏水作用在蛋白质折叠中起主要作用.研究表明二维HP模型...
  • 作者: 吕强 罗升
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年2期
    页码:  117-122
    摘要: 蛋白质结构预测中,采样是指在构象空间中生成具有最小自由能的状态.传统的采样方法是对自由度直接赋值.这种方法在处理较少的残基时能取得好的效果.但是对于包含100个残基以上的蛋白质结构,由于构象...
  • 作者: 周小禹
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年2期
    页码:  123-126
    摘要: 阿尔茨海默病又称老年性痴呆,是一种复杂的中枢神经系统退行性疾病,本文选取一套阿尔茨海默病全基因组关联分析(GWAS)数据,利用ProxyGeneLD软件进行基因水平上的检验,利用WebGes...
  • 作者: 周蔓 张鹏飞 李萍 王宁
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年3期
    页码:  127-133
    摘要: GGPS是萜类化合物合成的一个重要分支点酶,同时也是合成GGPP的催化酶。本课题共选择了9个不同科的植物,对其GGPS核苷酸及氨基酸序列的理化性质、蛋白质结构功能以及亲缘进化关系等进行详细的...
  • 作者: 叶静 金殿川 陈伟
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年3期
    页码:  134-138
    摘要: 热休克蛋白90( Heat shock protein 90,Hsp90)是生物体受到刺激时发生应激反应而产生的一类应激蛋白。 Hsp90包含Hsp90A, Hsp90B, Hsp90C, ...
  • 作者: 宋有涛 张桥石 李灌澍 窦薛楷 薛友林
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年3期
    页码:  139-145
    摘要: 大肠杆菌分子伴侣蛋白DnaK氮端核苷酸结合域( NBD, nucleotide-binding domain)的II-A和II-B子域之间的一些高度保守的扭链残基突变后( I202A, S2...
  • 作者: 张园园 慕小倩 李文燕 段龙飞 郭邦利 陈国爱
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年3期
    页码:  146-155
    摘要: 茉莉酸( Jasmonic acid, JA)存在于所有高等植物中,是植物对病原微生物和虫害防御反应的关键激素。在茉莉酸信号转导中,COI1( COR-insensitive 1)作为茉莉酸...
  • 作者: 丁忠庆 井晶 卢卫红 姜华 张兰威 王振宇
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年3期
    页码:  156-159
    摘要: 为提升学生学习兴趣,培养学生自主学习的能力是当前教育关注的首要问题。本文针对在生物技术课堂上遇到的实际问题,提出建立多媒体资料库,引导学生自己提出问题并加以解决,拓展学生思路,提高了教学效果...
  • 作者: 丁德武 孙啸 汪慧 谢建明
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年3期
    页码:  160-166
    摘要: 高通量测序技术的快速发展催生了涵盖各层次细胞生命活动的组学数据,如转录组学数据、蛋白质组学数据和互作组学数据等。同时,全基因组代谢网络模型在不断完善和增多。整合组学数据,对生物细胞的代谢网络...
  • 作者: 孙瑜 蔡小宁 陈德富 高山
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年3期
    页码:  167-172
    摘要: 韩春雨等发明的DNA指导的基因组编辑系统NgAgo-gDNA,比原有的RNA指导的基因组编辑系统CRISPR-Cas9在靶向特异性(防脱靶),反应可控性和基因组编辑范围等方面都有显著的改进。...
  • 作者: 方刚
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年3期
    页码:  173-180
    摘要: GenoCAD( www.genocad.com)是一种基于Web的免费合成生物学设计软件,用它可以进行表达载体及人工基因网络设计。持续点击代表各种合成生物学标准“零件”的图标,以一种语法进...
  • 作者: 曹晨 马堃
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年3期
    页码:  181-187
    摘要: 蛋白质二级结构是指蛋白质骨架结构中有规律重复的构象。由蛋白质原子坐标正确地指定蛋白质二级结构是分析蛋白质结构与功能的基础,二级结构的指定对于蛋白质分类、蛋白质功能模体的发现以及理解蛋白质折叠...
  • 作者: 李一佳 李凯 李鑫 马磊
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2016年3期
    页码:  188-194
    摘要: SeqMule可根据调用的人类基因组和外显子组数据自动调节变量,对所有测序数据的单核苷酸多态性( Single nucleo-tide polymorphism,SNP)进行分析和注释。目的...

生物信息学基本信息

刊名 生物信息学 主编 任南琪
曾用名
主办单位 哈尔滨工业大学  主管单位 中华人民共和国工业和信息化部
出版周期 季刊 语种
chi
ISSN 1672-5565 CN 23-1513/Q
邮编 150001 电子邮箱 itgene@sohu.com
电话 0451-86414135;0451-86417711(吴永英) 网址 http://swxxx.alljournals.cn/ch/index.aspx
地址 黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼

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