嗜酸乳杆菌zrx02的plnD基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 冉军舰 卢艳清 梁新红 焦凌霞 蔡丽丽 赵瑞香
• 来源期刊: 食品工业科技
• 学科: 工学
• 关键词: 嗜酸乳杆菌 细菌素 plnD基因 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（24）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 137-141,226
• 页数: 6页
• 分类号: TS201.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.13386/j.issn1002-0306.2017.24.027

摘要

目的:对zrx02嗜酸乳杆菌细菌素编码基因进行克隆与序列分析.方法:对分离出的菌株进行16S rRNA鉴定,并根据已报道的plnD编码产物基因设计引物,以该菌基因组DNA为模板进行PCR扩增和测序,利用Pro Param tool,TMHMM等在线软件对编码蛋白进行生物信息学分析.结果:该菌为嗜酸乳杆菌,命名为嗜酸乳杆菌zrx02,该菌含有plnD基因,通过与GenBank中相关的抗菌素基因进行比对,发现其基因序列与GenBank库中的Lactobacillus plantarumstrain(WP 016526896.1)plnD gene的同源性达到100％.生物信息学分析显示该基因全长355 bp,编码92个氨基酸,相对分子量10.54 ku,理论等电点9.26,该基因编码蛋白是稳定蛋白,不具有明显的跨膜结构,二级结构主要有α-螺旋、无规则卷曲和延伸链组成,三级结构结果显示plnD蛋白模型与Streptococcus pneumoniae中的ComE同源性最高.结论:对嗜酸乳杆菌zrx02 plnD基因的克隆与分析,为进一步探究细菌素的形成机制奠定理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	梁新红	河南科技学院食品学院	95	422	10.0	16.0
2	焦凌霞	河南科技学院食品学院	27	139	5.0	11.0
3	赵瑞香	河南科技学院食品学院	60	366	10.0	15.0
4	冉军舰	河南科技学院食品学院	24	104	7.0	9.0
5	蔡丽丽		5	7	2.0	2.0
6	卢艳清	河南科技学院食品学院	4	6	1.0	2.0